RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606884.1

GMDS-AS1-215, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 580 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.03□□□□□ -0.8
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ISCA1Q9BUE6 129 aa10.03□□□□□ -0.8
GMDS-AS1-215ENST00000606884 DEFB129Q9H1M3 183 aa10.03□□□□□ -0.8
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TRPC6Q9Y210 931 aa10.03□□□□□ -0.8
GMDS-AS1-215ENST00000606884 DLG5Q8TDM6 1919 aa10.03□□□□□ -0.8
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZNF804BA4D1E1 1349 aa10.03□□□□□ -0.8
GMDS-AS1-215ENST00000606884 VCANP13611 3396 aa10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GJB1P08034 283 aa10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ATP2B4P23634 1241 aa10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PRKG1Q13976 671 aa10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MTMR14Q8NCE2 650 aa10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SH3TC2Q8TF17 1288 aa10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 XAGE3Q8WTP9 111 aa10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FAM89AQ96GI7 184 aa10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 BABAM1Q9NWV8 329 aa10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ECM29Q5VYK3 1845 aa10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.02□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 OTOFQ9HC10 1997 aa10.01□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SASH1O94885 1247 aa10.01□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 LRIT3Q3SXY7 679 aa10.01□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa10.01□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 DEFB123Q8N688 67 aa10.01□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PLBD2Q8NHP8 589 aa10.01□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MTMR10Q9NXD2 777 aa10.01□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TLR2O60603 784 aa10□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ANXA1P04083 346 aa10□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MTFR1Q15390 333 aa10□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 COA1Q9GZY4 146 aa10□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PRDM6Q9NQX0 595 aa10□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FZD1Q9UP38 647 aa10□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KIF22Q14807 665 aa9.99□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.99□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 BRI3BPQ8WY22 251 aa9.99□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 OPTNQ96CV9 577 aa9.99□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GDF15Q99988 308 aa9.99□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.99□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GTF2A2P52657 109 aa9.98□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MXD3Q9BW11 206 aa9.98□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TSPYL4Q9UJ04 414 aa9.98□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa9.98□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.97□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 EVI5O60447 810 aa9.97□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 NEFMP07197 916 aa9.97□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GRK4P32298 578 aa9.97□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 NFE2L2Q16236 605 aa9.97□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CCL15Q16663 113 aa9.97□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FAM43AQ8N2R8 423 aa9.97□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.97□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa9.97□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SRRDQ9UH36 339 aa9.97□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TTC28Q96AY4 2481 aa9.97□□□□□ -0.81
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CCL5P13501 91 aa9.96□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 DLGAP5Q15398 846 aa9.96□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.96□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.96□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 STAP2Q9UGK3 403 aa9.96□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa9.96□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MYO1BO43795 1136 aa9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PDE8AO60658 829 aa9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 HOXB7P09629 217 aa9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 HOXD10P28358 340 aa9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 UBXN2AP68543 259 aa9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TTLL5Q6EMB2 1281 aa9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 Q7L0L9 218 aa9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 RNF208Q9H0X6 261 aa9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 RPTORQ8N122 1335 aa9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FAM205AQ6ZU69 1335 aa9.94□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ADGRA2Q96PE1 1338 aa9.94□□□□□ -0.82
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms