RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	RNF186	Q9NXI6	227 aa		18.8	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	IL1R1	P14778	569 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	SLFN5	Q08AF3	891 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	LRRC24	Q50LG9	513 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		18.79	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	UTY	O14607	1347 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	TRPA1	O75762	1119 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	GYG1	P46976	350 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	GRIK5	Q16478	980 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	OGFOD1	Q8N543	542 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	CCDC102A	Q96A19	550 aa		18.78	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	CLRN2	A0PK11	232 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	LAMB1	P07942	1786 aa		18.77	■□□□□ 0.6
FCHO1-231	ENST00000600201	CA12	O43570	354 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		18.76	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	DGKZ	Q13574	1117 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	CFAP100	Q494V2	611 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		18.75	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201		E9PSI1	815 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	USP44	Q9H0E7	712 aa		18.74	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	FKBP1B	P68106	108 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	DLGAP5	Q15398	846 aa		18.73	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	SPDYE6	P0CI01	402 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		18.72	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	UBE4A	Q14139	1066 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	VEZT	Q9HBM0	779 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	PTPRC	P08575	1304 aa		18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	18.71	■□□□□ 0.59
FCHO1-231	ENST00000600201	TBC1D8	O95759	1140 aa		18.7	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		18.7	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	METTL24	Q5JXM2	366 aa		18.69	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		18.69	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	18.68	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		18.68	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		18.68	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	NF2	P35240	595 aa		18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	GJA5	P36382	358 aa		18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	BCAM	P50895	628 aa		18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	TNN	Q9UQP3	1299 aa		18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		18.67	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	RASA3	Q14644	834 aa		18.66	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	SPRYD7	Q5W111	196 aa		18.66	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		18.66	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	PDE8B	O95263	885 aa		18.65	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	FGFR2	P21802	821 aa		18.65	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	CRK	P46108	304 aa		18.65	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	CACNB3	P54284	484 aa		18.65	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		18.65	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		18.65	■□□□□ 0.58
FCHO1-231	ENST00000600201	TM4SF4	P48230	202 aa		18.64	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	MMP14	P50281	582 aa		18.64	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		18.64	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	TEPSIN	Q96N21	525 aa		18.64	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		18.64	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		18.63	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	18.63	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	SOX10	P56693	466 aa		18.63	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	MAP3K11	Q16584	847 aa		18.63	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		18.63	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	WNK4	Q96J92	1243 aa		18.63	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		18.63	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	SIL1	Q9H173	461 aa		18.63	■□□□□ 0.57
FCHO1-231	ENST00000600201	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	18.63	■□□□□ 0.57

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