RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597793.5

PTOV1-209, Transcript of prostate tumor overexpressed 1, human

TSL 1 (best)

Gene PTOV1, Length 1,716 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTOV1-209	ENST00000597793	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		23.54	■■□□□ 1.36
PTOV1-209	ENST00000597793	CDC45	O75419	566 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PTOV1-209	ENST00000597793	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	23.53	■■□□□ 1.36
PTOV1-209	ENST00000597793	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PTOV1-209	ENST00000597793	AOX1	Q06278	1338 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PTOV1-209	ENST00000597793	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	23.53	■■□□□ 1.36
PTOV1-209	ENST00000597793	DOK7	Q18PE1	504 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PTOV1-209	ENST00000597793	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PTOV1-209	ENST00000597793	STAP2	Q9UGK3	403 aa		23.53	■■□□□ 1.36
PTOV1-209	ENST00000597793	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	23.52	■■□□□ 1.36
PTOV1-209	ENST00000597793	ATP5J	P18859	108 aa		23.52	■■□□□ 1.36
PTOV1-209	ENST00000597793	PSME4	Q14997	1843 aa		23.52	■■□□□ 1.36
PTOV1-209	ENST00000597793	PRELP	P51888	382 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	PDE1A	P54750	535 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	23.51	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	RNF181	Q9P0P0	153 aa		23.51	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	23.5	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	COL4A5	P29400	1685 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	FZD9	O00144	591 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		23.5	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	RASGRF1	Q13972	1273 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		23.49	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	23.48	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	23.48	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	SPATA5	Q8NB90	893 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		23.48	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	USP17L3	A6NCW0	530 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	USP17L4	A6NCW7	530 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	MCAM	P43121	646 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	SCN9A	Q15858	1988 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	YDJC	A8MPS7	323 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	TNIP1	Q15025	636 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	23.47	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		23.47	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	23.47	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	UTRN	P46939	3433 aa		23.46	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	23.46	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	HAUS7	Q99871	368 aa		23.46	■■□□□ 1.35
PTOV1-209	ENST00000597793	IGSF3	O75054	1194 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	23.45	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	GTF2I	P78347	998 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	SDS	P20132	328 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	SCARF1	Q14162	830 aa		23.45	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	23.45	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	CASC1	Q6TDU7	716 aa		23.44	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	23.44	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		23.44	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	23.44	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	CXCL9	Q07325	125 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	23.43	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	FBXW7	Q969H0	707 aa		23.43	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	23.43	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	23.42	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	RAD17	O75943	681 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	ZAP70	P43403	619 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	BECN1	Q14457	450 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	DACT2	Q5SW24	774 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	23.42	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		23.42	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	PSMD14	O00487	310 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	GPC2	Q8N158	579 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	23.41	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	SNRK	Q9NRH2	765 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		23.41	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	23.4	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	MMP14	P50281	582 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	23.4	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	PI16	Q6UXB8	463 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		23.4	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	23.39	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	23.39	■■□□□ 1.34
PTOV1-209	ENST00000597793	TICAM2	Q86XR7	235 aa		23.39	■■□□□ 1.33
PTOV1-209	ENST00000597793	DOCK2	Q92608	1830 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PTOV1-209	ENST00000597793	GOLIM4	O00461	696 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PTOV1-209	ENST00000597793	CNTROB	Q8N137	903 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PTOV1-209	ENST00000597793	EVI5L	Q96CN4	794 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PTOV1-209	ENST00000597793	ABCF2	Q9UG63	623 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PTOV1-209	ENST00000597793	MAST3	O60307	1309 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PTOV1-209	ENST00000597793	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		23.38	■■□□□ 1.33
PTOV1-209	ENST00000597793	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	23.37	■■□□□ 1.33
PTOV1-209	ENST00000597793	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PTOV1-209	ENST00000597793	JAG2	Q9Y219	1238 aa		23.37	■■□□□ 1.33
PTOV1-209	ENST00000597793	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	23.36	■■□□□ 1.33
PTOV1-209	ENST00000597793	DPF2	Q92785	391 aa		23.36	■■□□□ 1.33

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