RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
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CTIF-211ENST00000592658 LAMA3Q16787 3333 aa17.01■□□□□ 0.31
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CTIF-211ENST00000592658 CERS5Q8N5B7 392 aa17.01■□□□□ 0.31
CTIF-211ENST00000592658 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa17.01■□□□□ 0.31
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CTIF-211ENST00000592658 A0A1B0GUL6 1792 aa16.93■□□□□ 0.3
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CTIF-211ENST00000592658 IL1R1P14778 569 aa16.93■□□□□ 0.3
CTIF-211ENST00000592658 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
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CTIF-211ENST00000592658 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.93■□□□□ 0.3
CTIF-211ENST00000592658 STK31Q9BXU1 1019 aa16.93■□□□□ 0.3
CTIF-211ENST00000592658 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
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CTIF-211ENST00000592658 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa16.93■□□□□ 0.3
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CTIF-211ENST00000592658 FAM43AQ8N2R8 423 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-211ENST00000592658 SHISA4Q96DD7 197 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-211ENST00000592658 MPHOSPH8Q99549 860 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-211ENST00000592658 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-211ENST00000592658 PRO3102Q9H379 93 aa16.92■□□□□ 0.3
CTIF-211ENST00000592658 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-211ENST00000592658 DLL1O00548 723 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-211ENST00000592658 KCNJ4P48050 445 aa16.91■□□□□ 0.3
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CTIF-211ENST00000592658 CCL15Q16663 113 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-211ENST00000592658 CDAN1Q8IWY9 1227 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-211ENST00000592658 TEPSINQ96N21 525 aa16.91■□□□□ 0.3
CTIF-211ENST00000592658 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.9■□□□□ 0.3
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CTIF-211ENST00000592658 TAF5LO75529 589 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-211ENST00000592658 SLC4A2P04920 1241 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-211ENST00000592658 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CTIF-211ENST00000592658 VGLL4Q14135 290 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-211ENST00000592658 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CTIF-211ENST00000592658 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa16.89■□□□□ 0.29
CTIF-211ENST00000592658 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.89■□□□□ 0.29
CTIF-211ENST00000592658 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CTIF-211ENST00000592658 UNC80Q8N2C7 3258 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-211ENST00000592658 GNRH1P01148 92 aa16.88■□□□□ 0.29
CTIF-211ENST00000592658 FLIIQ13045 1269 aa16.88■□□□□ 0.29
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