RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	24.93	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	24.92	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	SCARF1	Q14162	830 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	USP48	Q86UV5	1035 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	CERS5	Q8N5B7	392 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	ATP2B3	Q16720	1220 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	24.9	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	BCAM	P50895	628 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	24.89	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	24.89	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	SULF1	Q8IWU6	871 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	24.89	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	24.89	■■□□□ 1.58
PSME3-209	ENST00000589469	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	24.88	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	CST9	Q5W186	159 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		24.88	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	24.88	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	ADM5	C9JUS6	153 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469		F8W031	263 aa	Predicted RBP	24.87	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	WNT10B	O00744	389 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	ATP8B2	P98198	1209 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	24.87	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	24.87	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	24.87	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	CNTNAP1	P78357	1384 aa		24.87	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	24.86	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	24.86	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	TFCP2	Q12800	502 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	24.85	■■□□□ 1.57	8e-6	■■□□□ 11.5
PSME3-209	ENST00000589469	POLA2	Q14181	598 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	DLGAP5	Q15398	846 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	JMY	Q8N9B5	988 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	SSH3	Q8TE77	659 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		24.85	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	DLK2	Q6UY11	383 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	COG6	Q9Y2V7	657 aa		24.84	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	RASSF10	A6NK89	507 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	24.83	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	24.83	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		24.83	■■□□□ 1.57
PSME3-209	ENST00000589469	CFAP100	Q494V2	611 aa		24.82	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	24.82	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	CEP85	Q6P2H3	762 aa		24.81	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	CDCA5	Q96FF9	252 aa		24.81	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	24.81	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469		A0A1B0GUL7	405 aa		24.8	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	ADORA1	P30542	326 aa		24.8	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	24.8	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	TIMM10	P62072	90 aa		24.8	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	24.8	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	PDE3A	Q14432	1141 aa		24.8	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	24.8	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		24.8	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	MYO1B	O43795	1136 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	24.79	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	SPDYE6	P0CI01	402 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	PHKA1	P46020	1223 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		24.79	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	SEMA3E	O15041	775 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	VEGFB	P49765	207 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	GRIK5	Q16478	980 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC102B	Q68D86	513 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	24.78	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	TNS4	Q8IZW8	715 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	XAGE2	Q96GT9	111 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	24.78	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		24.78	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		24.77	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	24.77	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		24.77	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	24.77	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		24.77	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	24.77	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	24.77	■■□□□ 1.56
PSME3-209	ENST00000589469	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		24.76	■■□□□ 1.55
PSME3-209	ENST00000589469	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		24.76	■■□□□ 1.55
PSME3-209	ENST00000589469	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	24.76	■■□□□ 1.55
PSME3-209	ENST00000589469	MAST3	O60307	1309 aa		24.76	■■□□□ 1.55
PSME3-209	ENST00000589469	ZBTB22	O15209	634 aa		24.75	■■□□□ 1.55
PSME3-209	ENST00000589469	ECE1	P42892	770 aa		24.75	■■□□□ 1.55
PSME3-209	ENST00000589469	CRK	P46108	304 aa		24.75	■■□□□ 1.55
PSME3-209	ENST00000589469	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	24.75	■■□□□ 1.55
PSME3-209	ENST00000589469	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		24.75	■■□□□ 1.55
PSME3-209	ENST00000589469	CLRN2	A0PK11	232 aa		24.74	■■□□□ 1.55

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