RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 EP400Q96L91 3159 aa7.54□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 SH3TC1Q8TE82 1336 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFRSF10AO00220 468 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP8B2P98198 1209 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 SIL1Q9H173 461 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 GREM2Q9H772 168 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 CDHR2Q9BYE9 1310 aa7.52□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
CAPNS1-208ENST00000589162 SRGAP3O43295 1099 aa7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE8AO60658 829 aa7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 CTSWP56202 376 aa7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 CNBD1Q8NA66 436 aa7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 MYH3P11055 1940 aa7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 NRXN2Q9P2S2 1712 aa7.52□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 CACNA1SQ13698 1873 aa7.51□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 CHRNA5P30532 468 aa7.51□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.51□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.51□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.51□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 CSF1RP07333 972 aa7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 ITGA6P23229 1130 aa7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC24Q50LG9 513 aa7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 SSH3Q8TE77 659 aa7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 NYXQ9GZU5 481 aa7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 SNAP23O00161 211 aa7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 RPIAP49247 311 aa7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 ST5P78524 1137 aa7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 MTX1Q13505 466 aa7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 OLFM4Q6UX06 510 aa7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC13Q8NBP0 860 aa7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 SENP2Q9HC62 589 aa7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 C3orf80F5H4A9 247 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 NR1I2O75469 434 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 SASH1O94885 1247 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 S1PR4O95977 384 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 ADH1BP00325 375 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 TFCP2Q12800 502 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 NLRP3Q96P20 1036 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 LNPKQ9C0E8 428 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 MTFR1LQ9H019 292 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 DCTPP1Q9H773 170 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GUL6 1792 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 LRP5O75197 1615 aa7.48□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 C10orf71Q711Q0 1435 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0G2JLW4 131 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 HMMRO75330 724 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF5LO75529 589 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 DPEP1P16444 411 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
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