RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 ARSDP51689 593 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-212ENST00000580838 DGKZQ13574 1117 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-212ENST00000580838 CDCA8Q53HL2 280 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-212ENST00000580838 GLMNQ92990 594 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-212ENST00000580838 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-212ENST00000580838 ATP10AO60312 1499 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-212ENST00000580838 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PTPRM-212ENST00000580838 DLL1O00548 723 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 MICAL2O94851 1124 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 RARAP10276 462 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 HFE2Q6ZVN8 426 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 USP35Q9P2H5 1018 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 IQGAP3Q86VI3 1631 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 DUOX2Q9NRD8 1548 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 ERBINQ96RT1 1412 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 OPLAHO14841 1288 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 NRLP54845 237 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 TMF1P82094 1093 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 USP20Q9Y2K6 914 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L15C9J2P7 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L10C9JJH3 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L12C9JPN9 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L11C9JVI0 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L21D6R901 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L18D6R9N7 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L22D6RA61 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L19D6RCP7 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L20D6RJB6 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 ALX3O95076 343 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 DEKP35659 375 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 USP17L24Q0WX57 530 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 NGEFQ8N5V2 710 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 MAGI2Q86UL8 1455 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 FAM196BA6NMK8 535 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 WEE1P30291 646 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 MYO19Q96H55 970 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 ARHGAP5Q13017 1502 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 J3QW42 95 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 EGFRP00533 1210 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 FSTP19883 344 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 PLD4Q96BZ4 506 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 ARXQ96QS3 562 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 A2MP01023 1474 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 SCAPERQ9BY12 1400 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 MYO5CQ9NQX4 1742 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRM-212ENST00000580838 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 F8W735 103 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 FOXO3O43524 673 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 SYCP2Q9BX26 1530 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 SYNMO15061 1565 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 NEURL4Q96JN8 1562 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 XYLBO75191 536 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRM-212ENST00000580838 MCTP1Q6DN14 999 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 ARAP3Q8WWN8 1544 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 SETDB1Q15047 1291 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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