RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STOX1Q6ZVD7 989 aa28.49■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa28.49■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RTL9Q8NET4 1388 aa28.48■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.48■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A0G2JLW4 131 aa28.47■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.15
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 APPBP2Q92624 585 aa28.47■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.47■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYH7P12883 1935 aa28.47■■■□□ 2.15
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C3orf67Q6ZVT6 689 aa28.46■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARAP2Q8WZ64 1704 aa28.46■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa28.46■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NARFQ9UHQ1 456 aa28.45■■■□□ 2.15
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTLL5Q6EMB2 1281 aa28.45■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FUCA2Q9BTY2 467 aa28.45■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COL4A1P02462 1669 aa28.44■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STK3Q13188 491 aa28.44■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 Q6ZUG5 572 aa28.44■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRC2Q9BYS8 371 aa28.44■■■□□ 2.14
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa28.43■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.43■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP25Q9UHP3 1055 aa28.43■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZPR1O75312 459 aa28.43■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHRNDQ07001 517 aa28.43■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.42■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.42■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLHL34Q8N239 644 aa28.42■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDCL3Q9H2J4 239 aa28.42■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FOXP2O15409 715 aa28.42■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADD2P35612 726 aa28.42■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LAMA4Q16363 1823 aa28.42■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 E7EWF7 191 aa28.41■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPAA1O43292 621 aa28.41■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATRNO75882 1429 aa28.41■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FGD1P98174 961 aa28.41■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPATA5Q8NB90 893 aa28.41■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SETDB2Q96T68 719 aa28.41■■■□□ 2.14
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.4■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RASGRF1Q13972 1273 aa28.4■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa28.4■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TPRNQ4KMQ1 711 aa28.4■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SBF2Q86WG5 1849 aa28.4■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.39■■■□□ 2.14
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADCY5O95622 1261 aa28.39■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UQCRHP07919 91 aa28.39■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BRF1Q92994 677 aa28.39■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.39■■■□□ 2.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAF1P21675 1872 aa28.38■■■□□ 2.13
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HAND2P61296 217 aa28.38■■■□□ 2.13
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CASZ1Q86V15 1759 aa28.38■■■□□ 2.13
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF532Q9HCE3 1301 aa28.38■■■□□ 2.13
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FGAP02671 866 aa28.37■■■□□ 2.13
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NYXQ9GZU5 481 aa28.37■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SASS6Q6UVJ0 657 aa28.37■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.37■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBE3CQ15386 1083 aa28.36■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KDM4AO75164 1064 aa28.35■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RBM10P98175 930 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC10A5Q5PT55 438 aa28.34■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHST3Q7LGC8 479 aa28.34■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GTF3C6Q969F1 213 aa28.34■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MPNDQ8N594 471 aa28.34■■■□□ 2.13
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