RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576427.1

NOMO3-215, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 2

Gene NOMO3, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-215ENST00000576427 PI4KAP2A4QPH2 592 aa11.98□□□□□ -0.49
NOMO3-215ENST00000576427 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.98□□□□□ -0.49
NOMO3-215ENST00000576427 NEXNQ0ZGT2 675 aa11.98□□□□□ -0.49
NOMO3-215ENST00000576427 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.98□□□□□ -0.49
NOMO3-215ENST00000576427 NLRP10Q86W26 655 aa11.98□□□□□ -0.49
NOMO3-215ENST00000576427 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.98□□□□□ -0.49
NOMO3-215ENST00000576427 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa11.98□□□□□ -0.49
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NOMO3-215ENST00000576427 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
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NOMO3-215ENST00000576427 BEND3Q5T5X7 828 aa11.89□□□□□ -0.51
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NOMO3-215ENST00000576427 CDHR2Q9BYE9 1310 aa11.88□□□□□ -0.51
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