RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.05□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 HLA-CQ95604 372 aa7.05□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 PSME4Q14997 1843 aa7.05□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.05□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.05□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 TAF1P21675 1872 aa7.04□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 ATP9BO43861 1147 aa7.04□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 STARD3NLO95772 234 aa7.04□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.04□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 RASAL3Q86YV0 1011 aa7.04□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 NIM1KQ8IY84 436 aa7.04□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.04□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 METRNQ9UJH8 293 aa7.04□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 RIC1Q4ADV7 1423 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 LAMB2P55268 1798 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 A0A1W2PPC1 479 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 H0YGN5 161 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 SMAPO00193 183 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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TRIM25-208ENST00000574234 GABBR2O75899 941 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 TBC1D8O95759 1140 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 CRY2Q49AN0 593 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 CLEC4GQ6UXB4 293 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 USP48Q86UV5 1035 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 SLF2Q8IX21 1173 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 ARMC5Q96C12 935 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 PRO3102Q9H379 93 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 MUC3AQ02505 3323 aa7.03□□□□□ -1.28
TRIM25-208ENST00000574234 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.02□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 CAMTA2O94983 1202 aa7.02□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 EN2P19622 333 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 TM4SF4P48230 202 aa7.02□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 FKBP1BP68106 108 aa7.02□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 CXCL9Q07325 125 aa7.02□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.02□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 GPR153Q6NV75 609 aa7.02□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.02□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 TRPM4Q8TD43 1214 aa7.02□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 TSC1Q92574 1164 aa7.02□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 TESK2Q96S53 571 aa7.02□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.02□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 KIF7Q2M1P5 1343 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 PTPREP23469 700 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 SLC39A6Q13433 755 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 TNIP1Q15025 636 aa7.01□□□□□ -1.29
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TRIM25-208ENST00000574234 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 POLKQ9UBT6 870 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 LHX6Q9UPM6 363 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF609O15014 1411 aa7.01□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 H7C1D1 291 aa7□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 PPIP5K2O43314 1243 aa7□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.297e-9■■■■■ 43.2
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TRIM25-208ENST00000574234 TMEM164Q5U3C3 297 aa7□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 OTOP1Q7RTM1 612 aa7□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 PNMA1Q8ND90 353 aa7□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7□□□□□ -1.29
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TRIM25-208ENST00000574234 ERBB4Q15303 1308 aa6.99□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 ALPK3Q96L96 1907 aa6.98□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 ALDH1A1P00352 501 aa6.98□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 SREBF2Q12772 1141 aa6.98□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TRIM25-208ENST00000574234 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.98□□□□□ -1.29
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