RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 COL4A5P29400 1685 aa18.8■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.8■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 SNRKQ9NRH2 765 aa18.8■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.8■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.8■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 SEMA3EO15041 775 aa18.79■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 IL1R1P14778 569 aa18.79■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 RASGRF1Q13972 1273 aa18.79■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 AOC3Q16853 763 aa18.79■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.79■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 COA1Q9GZY4 146 aa18.79■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 VPS33BQ9H267 617 aa18.79■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 PPIP5K2O43314 1243 aa18.78■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 ZAP70P43403 619 aa18.78■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 DOK7Q18PE1 504 aa18.78■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 PI16Q6UXB8 463 aa18.78■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 SPATA5Q8NB90 893 aa18.78■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 DENND2AQ9ULE3 1009 aa18.78■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa18.77■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 SDSP20132 328 aa18.77■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 IARSP41252 1262 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 C1QTNF8P60827 252 aa18.77■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 DBNDD1Q9H9R9 158 aa18.77■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa18.77■□□□□ 0.6
CTU2-209ENST00000567316 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 G3V3G9 751 aa18.76■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 DCAF8Q5TAQ9 597 aa18.76■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 RILPL2Q969X0 211 aa18.76■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 ANTXR1Q9H6X2 564 aa18.76■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 PAG1Q9NWQ8 432 aa18.76■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 ECM29Q5VYK3 1845 aa18.75■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 GOLIM4O00461 696 aa18.75■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 ECE2O60344 883 aa18.75■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 CNTROBQ8N137 903 aa18.75■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 LARGE2Q8N3Y3 721 aa18.75■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 EVI5LQ96CN4 794 aa18.75■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 PODNQ7Z5L7 613 aa18.74■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 FAM205AQ6ZU69 1335 aa18.74■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa18.73■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 GLTPD2A6NH11 291 aa18.72■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 YDJCA8MPS7 323 aa18.72■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.72■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 KBTBD3Q8NAB2 608 aa18.72■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 JAG2Q9Y219 1238 aa18.72■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 GTF2IP78347 998 aa18.71■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 NIM1KQ8IY84 436 aa18.71■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 WDR66Q8TBY9 1149 aa18.71■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 FSD1Q9BTV5 496 aa18.71■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 KCNQ5Q9NR82 932 aa18.71■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 SALL1Q9NSC2 1324 aa18.71■□□□□ 0.59
CTU2-209ENST00000567316 RFX7Q2KHR2 1363 aa18.7■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 FOCADQ5VW36 1801 aa18.7■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 TTLL5Q6EMB2 1281 aa18.7■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 WDR90Q96KV7 1748 aa18.69■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 KIF3CO14782 793 aa18.69■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 ABCF2Q9UG63 623 aa18.69■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 ZNRF3Q9ULT6 936 aa18.69■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 FZD9O00144 591 aa18.68■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 CDC45O75419 566 aa18.68■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 STRIP1Q5VSL9 837 aa18.68■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.68■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa18.68■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 JDP2Q8WYK2 163 aa18.68■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 FBXW7Q969H0 707 aa18.68■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 USP17L3A6NCW0 530 aa18.67■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 USP17L4A6NCW7 530 aa18.67■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 IDH1O75874 414 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 CHMLP26374 656 aa18.67■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 MFSD14BQ5SR56 506 aa18.67■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 USP17L1Q7RTZ2 530 aa18.67■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 TICAM2Q86XR7 235 aa18.67■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.67■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 CHGBP05060 677 aa18.66■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 GRIK5Q16478 980 aa18.66■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 DACT2Q5SW24 774 aa18.66■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 ERICH6Q7L0X2 663 aa18.66■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 CERS5Q8N5B7 392 aa18.66■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 MXD3Q9BW11 206 aa18.66■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.66■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 MYH1P12882 1939 aa18.66■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
CTU2-209ENST00000567316 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms