RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567264.1

UBFD1-208, Transcript of ubiquitin family domain containing 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene UBFD1, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBFD1-208	ENST00000567264	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		27.74	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		27.74	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	MX1	P20591	662 aa		27.73	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	RASGRF1	Q13972	1273 aa		27.73	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	JAG2	Q9Y219	1238 aa		27.73	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	SCN9A	Q15858	1988 aa		27.73	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		27.73	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		27.72	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.72	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		27.72	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		27.72	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		27.72	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	PSMD14	O00487	310 aa		27.71	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	ATP5J	P18859	108 aa		27.71	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	MCAM	P43121	646 aa		27.71	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	SCARF1	Q14162	830 aa		27.71	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	SPATA5	Q8NB90	893 aa		27.71	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	27.71	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		27.71	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		27.7	■■■□□ 2.03
UBFD1-208	ENST00000567264	DACT2	Q5SW24	774 aa		27.7	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		27.7	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		27.7	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	PSME4	Q14997	1843 aa		27.69	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	UTRN	P46939	3433 aa		27.69	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	ERC2	O15083	957 aa		27.69	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	GPC2	Q8N158	579 aa		27.69	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	SNRK	Q9NRH2	765 aa		27.69	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	PDE1A	P54750	535 aa		27.68	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		27.68	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		27.68	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	STAP2	Q9UGK3	403 aa		27.68	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		27.67	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	PDE4A	P27815	886 aa		27.67	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		27.67	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	PI16	Q6UXB8	463 aa		27.67	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		27.66	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	GLTPD2	A6NH11	291 aa		27.65	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	ZAP70	P43403	619 aa		27.65	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	MXD3	Q9BW11	206 aa		27.65	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	AOX1	Q06278	1338 aa		27.65	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		27.65	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.64	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		27.64	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	HAUS7	Q99871	368 aa		27.64	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		27.64	■■■□□ 2.02
UBFD1-208	ENST00000567264	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	CERS5	Q8N5B7	392 aa		27.63	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		27.63	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	ABCF2	Q9UG63	623 aa		27.63	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		27.62	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		27.61	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		27.61	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	GOLIM4	O00461	696 aa		27.6	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		27.6	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		27.6	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	DPF2	Q92785	391 aa		27.6	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	GML	Q99445	158 aa		27.6	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		27.6	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264		F8W031	263 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		27.59	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	USP17L8	P0C7I0	530 aa		27.58	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	OGFOD1	Q8N543	542 aa		27.58	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		27.58	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		27.58	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
UBFD1-208	ENST00000567264	PRDX5	P30044	214 aa		27.57	■■■□□ 2
UBFD1-208	ENST00000567264	RGS3	P49796	1198 aa		27.57	■■■□□ 2
UBFD1-208	ENST00000567264	SCNN1D	P51172	638 aa		27.57	■■■□□ 2
UBFD1-208	ENST00000567264	GRIK5	Q16478	980 aa		27.57	■■■□□ 2
UBFD1-208	ENST00000567264	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
UBFD1-208	ENST00000567264	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		27.57	■■■□□ 2
UBFD1-208	ENST00000567264	RAI14	Q9P0K7	980 aa		27.57	■■■□□ 2
UBFD1-208	ENST00000567264	MAST3	O60307	1309 aa		27.57	■■■□□ 2
UBFD1-208	ENST00000567264	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
UBFD1-208	ENST00000567264	SKAP1	Q86WV1	359 aa		27.56	■■■□□ 2
UBFD1-208	ENST00000567264	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
UBFD1-208	ENST00000567264	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
UBFD1-208	ENST00000567264		H7C1D1	291 aa		27.55	■■■□□ 2
UBFD1-208	ENST00000567264	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
UBFD1-208	ENST00000567264	MMP14	P50281	582 aa		27.55	■■■□□ 2

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