RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566905.5

PKD1-232, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-232ENST00000566905 LPIN2Q92539 896 aa23.67■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 CREBZFQ9NS37 354 aa23.67■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.66■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 F8W031 263 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 SCARF1Q14162 830 aa23.66■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.66■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 COG6Q9Y2V7 657 aa23.66■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.65■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.65■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 USP48Q86UV5 1035 aa23.65■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.65■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 GGA3Q9NZ52 723 aa23.65■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.64■■□□□ 1.38
PKD1-232ENST00000566905 ATP8B2P98198 1209 aa23.64■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 TFCP2Q12800 502 aa23.63■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.63■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.63■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 ADM5C9JUS6 153 aa23.62■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.62■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 DLK2Q6UY11 383 aa23.62■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 KLRG1Q96E93 195 aa23.62■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.62■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.62■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 MMP14P50281 582 aa23.61■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 POLA2Q14181 598 aa23.61■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.61■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 SSH3Q8TE77 659 aa23.61■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 WNT10BO00744 389 aa23.6■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 CELF2O95319 508 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 SULF1Q8IWU6 871 aa23.6■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.6■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 ADORA1P30542 326 aa23.59■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 TIMM10P62072 90 aa23.59■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 CST9Q5W186 159 aa23.59■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 CEP85Q6P2H3 762 aa23.59■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.59■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 A0A1B0GUL7 405 aa23.58■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 DLGAP5Q15398 846 aa23.58■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PKD1-232ENST00000566905 PHKA1P46020 1223 aa23.57■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 PDE3AQ14432 1141 aa23.57■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 CFAP100Q494V2 611 aa23.57■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.57■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.57■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.57■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.56■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 CNTNAP1P78357 1384 aa23.55■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 GRIK5Q16478 980 aa23.55■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 XAGE2Q96GT9 111 aa23.55■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.55■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 CCDC102BQ68D86 513 aa23.54■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.53■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.53■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 CDCA5Q96FF9 252 aa23.53■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.52■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 SPDYE6P0CI01 402 aa23.52■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 GORABQ5T7V8 394 aa23.52■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.52■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PKD1-232ENST00000566905 CLRN2A0PK11 232 aa23.51■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 RASSF10A6NK89 507 aa23.51■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 MYO1BO43795 1136 aa23.51■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 CRKP46108 304 aa23.51■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.51■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.51■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.51■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.51■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 SEMA3EO15041 775 aa23.5■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.5■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 AOX1Q06278 1338 aa23.5■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 VEGFBP49765 207 aa23.49■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 GRM1Q13255 1194 aa23.49■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 TNNI3KQ59H18 835 aa23.49■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.49■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 JMYQ8N9B5 988 aa23.49■■□□□ 1.35
PKD1-232ENST00000566905 VEZTQ9HBM0 779 aa23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms