RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564744.1

RPL4-208, Transcript of ribosomal protein L4, human

TSL 2

Gene RPL4, Length 671 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL4-208	ENST00000564744	SCARF1	Q14162	830 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	PI16	Q6UXB8	463 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	SNRK	Q9NRH2	765 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	MYH7	P12883	1935 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	SCN4A	P35499	1836 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	USP17L3	A6NCW0	530 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	USP17L4	A6NCW7	530 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744		F8W031	263 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	PODN	Q7Z5L7	613 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	GCC1	Q96CN9	775 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	LNPK	Q9C0E8	428 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	AK9	Q5TCS8	1911 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	DOCK2	Q92608	1830 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	GLTPD2	A6NH11	291 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	RASGRF1	Q13972	1273 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	TNIP1	Q15025	636 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	GRIK5	Q16478	980 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	DACT2	Q5SW24	774 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	SMC5	Q8IY18	1101 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	GPC2	Q8N158	579 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	CERS5	Q8N5B7	392 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	RRAGC	Q9HB90	399 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	MCAM	P43121	646 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	SKAP1	Q86WV1	359 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	EPS15	P42566	896 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	ZAP70	P43403	619 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	SCNN1D	P51172	638 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	MICALL2	Q8IY33	904 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	SPATA5	Q8NB90	893 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RPL4-208	ENST00000564744	POTEC	B2RU33	542 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	NUCB1	Q02818	461 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	ABCF2	Q9UG63	623 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	SEMA3E	O15041	775 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	EGFR	P00533	1210 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	MX1	P20591	662 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	PDE4A	P27815	886 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	PRDX5	P30044	214 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	GML	Q99445	158 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	HACL1	Q9UJ83	578 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744		H7C1D1	291 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	GOLIM4	O00461	696 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	CAPN15	O75808	1086 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	10.37	□□□□□ -0.75
RPL4-208	ENST00000564744	USP17L8	P0C7I0	530 aa		10.37	□□□□□ -0.75

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