RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563854.1

NME3-205, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 5

Gene NME3, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-205ENST00000563854 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.2■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 UBE4AQ14139 1066 aa22.19■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 DLGAP5Q15398 846 aa22.19■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.19■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.19■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 MOB2Q70IA6 237 aa22.18■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 CCDC102AQ96A19 550 aa22.18■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 NF2P35240 595 aa22.17■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 MMP14P50281 582 aa22.17■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 VPS37DQ86XT2 251 aa22.17■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.17■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 CA12O43570 354 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 SLC10A3P09131 477 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 FKBP1BP68106 108 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 PRKG1Q13976 671 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 CFAP100Q494V2 611 aa22.15■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NME3-205ENST00000563854 CLRN2A0PK11 232 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.14■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 MYO1BO43795 1136 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 VEZTQ9HBM0 779 aa22.13■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 KIF16BQ96L93 1317 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 PDE8BO95263 885 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 MIER1Q8N108 512 aa22.12■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 SPDYE6P0CI01 402 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 SIL1Q9H173 461 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.11■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.1■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 AOX1Q06278 1338 aa22.09■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 EYA2O00167 538 aa22.09■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.09■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.09■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 FZD1Q9UP38 647 aa22.09■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 BCAMP50895 628 aa22.08■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 MEIS3Q99687 375 aa22.08■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
NME3-205ENST00000563854 TRPA1O75762 1119 aa22.07■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 CSRNP1Q96S65 589 aa22.07■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 SLC5A1P13866 664 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 RNF186Q9NXI6 227 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.06■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 CRKP46108 304 aa22.05■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 GRIK5Q16478 980 aa22.05■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 ABHD8Q96I13 439 aa22.05■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.05■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.04■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 BCAR3O75815 825 aa22.04■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 FGFR2P21802 821 aa22.04■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.04■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.04■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.04■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 TNNQ9UQP3 1299 aa22.04■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.04■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.04■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 RASA3Q14644 834 aa22.03■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 LPIN2Q92539 896 aa22.03■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.03■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NME3-205ENST00000563854 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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