RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563387.5

C15orf40-210, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3

Gene C15orf40, Length 419 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-210ENST00000563387 SAAL1Q96ER3 474 aa5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ERO1AQ96HE7 468 aa5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 MPP4Q96JB8 637 aa5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 CCDC114Q96M63 670 aa5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 UIMC1Q96RL1 719 aa5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 NACA2Q9H009 215 aa5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 MCM8Q9UJA3 840 aa5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ITM2BQ9Y287 266 aa5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 IKBKGQ9Y6K9 419 aa5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 KDM2BQ8NHM5 1336 aa5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 MSH6P52701 1360 aa5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 TONSLQ96HA7 1378 aa5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ATRNO75882 1429 aa5.14□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 PZPP20742 1482 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 F8VZ95 297 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 PDLIM1O00151 329 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ERC2O15083 957 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 MYO1BO43795 1136 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ERLIN2O94905 339 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 FAM163BP0C2L3 166 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF24P17028 368 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ALDH1B1P30837 517 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ABL2P42684 1182 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 RANBP1P43487 201 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 RAB27AP51159 221 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 RAB3GAP1Q15042 981 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ARMC9Q7Z3E5 817 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 MFN1Q8IWA4 741 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 TRIML1Q8N9V2 468 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 FAM81AQ8TBF8 368 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 HDAC7Q8WUI4 952 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 DDX12PQ92771 950 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 TBC1D32Q96NH3 1257 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 TCHPQ9BT92 498 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 TRIM4Q9C037 500 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 BATF3Q9NR55 127 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 PLSCR2Q9NRY7 297 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 SPATA7Q9P0W8 599 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 WDR37Q9Y2I8 494 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 UBR1Q8IWV7 1749 aa5.13□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 MAST1Q9Y2H9 1570 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 H7C1W4 665 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 KIF3BO15066 747 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 CHUKO15111 745 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 TBC1D12O60347 775 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 RPS6KA5O75582 802 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 KIAA0754O94854 1291 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 TRIM37O94972 964 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 MBD3O95983 291 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 MYL1P05976 194 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 FOSL1P15407 271 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 DESP17661 470 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 FOSBP53539 338 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 AKNAD1Q5T1N1 836 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 RCSD1Q6JBY9 416 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 GGT6Q6P531 493 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 TMCO3Q6UWJ1 677 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 CCDC50Q8IVM0 306 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ATP11CQ8NB49 1132 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ZNF280CQ8ND82 737 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 BICD2Q8TD16 824 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 NUP133Q8WUM0 1156 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 OSBPL9Q96SU4 736 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 SLX1AQ9BQ83 275 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 TSPY26PQ9H489 355 aa5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
C15orf40-210ENST00000563387 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms