RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
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RABGGTA-211ENST00000559850 MTX1Q13505 466 aa18.47■□□□□ 0.55
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RABGGTA-211ENST00000559850 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.47■□□□□ 0.55
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RABGGTA-211ENST00000559850 KRT26Q7Z3Y9 468 aa18.46■□□□□ 0.55
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RABGGTA-211ENST00000559850 CEP126Q9P2H0 1117 aa18.46■□□□□ 0.55
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RABGGTA-211ENST00000559850 SLC5A1P13866 664 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 ATP2B3Q16720 1220 aa18.45■□□□□ 0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 FAM205AQ6ZU69 1335 aa18.45■□□□□ 0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 TFCP2Q12800 502 aa18.44■□□□□ 0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 MFSD14BQ5SR56 506 aa18.44■□□□□ 0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 COG6Q9Y2V7 657 aa18.44■□□□□ 0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 CNTNAP1P78357 1384 aa18.43■□□□□ 0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 SULF1Q8IWU6 871 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 HDAC9Q9UKV0 1011 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 AOX1Q06278 1338 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.42■□□□□ 0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa18.42■□□□□ 0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 VEGFBP49765 207 aa18.41■□□□□ 0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 TIMM10P62072 90 aa18.41■□□□□ 0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 ATP8B2P98198 1209 aa18.41■□□□□ 0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 GRM1Q13255 1194 aa18.41■□□□□ 0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 CFAP100Q494V2 611 aa18.41■□□□□ 0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 CDCA5Q96FF9 252 aa18.41■□□□□ 0.54
RABGGTA-211ENST00000559850 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
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RABGGTA-211ENST00000559850 CYP4F22Q6NT55 531 aa18.38■□□□□ 0.53
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RABGGTA-211ENST00000559850 CCDC102BQ68D86 513 aa18.36■□□□□ 0.53
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RABGGTA-211ENST00000559850 RASGRF1Q13972 1273 aa18.33■□□□□ 0.52
RABGGTA-211ENST00000559850 PRKG1Q13976 671 aa18.33■□□□□ 0.52
RABGGTA-211ENST00000559850 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
RABGGTA-211ENST00000559850 C2orf69Q8N8R5 385 aa18.33■□□□□ 0.52
RABGGTA-211ENST00000559850 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa18.33■□□□□ 0.52
RABGGTA-211ENST00000559850 SERPINA10Q9UK55 444 aa18.33■□□□□ 0.52
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