RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.96■■□□□ 1.75
TMOD3-203ENST00000558455 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TMOD3-203ENST00000558455 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.95■■□□□ 1.75
TMOD3-203ENST00000558455 CEP85Q6P2H3 762 aa25.95■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 OGFOD1Q8N543 542 aa25.95■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 TFCP2Q12800 502 aa25.94■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 TRAF5O00463 557 aa25.93■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.93■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 SCARF1Q14162 830 aa25.91■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.91■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 GGA3Q9NZ52 723 aa25.91■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 HDAC9Q9UKV0 1011 aa25.91■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 F8W031 263 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 ADORA1P30542 326 aa25.9■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 MMP14P50281 582 aa25.9■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.9■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 A0A1B0GUL7 405 aa25.89■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 TIMM10P62072 90 aa25.89■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.89■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 CREBZFQ9NS37 354 aa25.89■■□□□ 1.74
TMOD3-203ENST00000558455 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.88■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.88■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.88■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.87■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 WNT10BO00744 389 aa25.87■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 PHKA1P46020 1223 aa25.87■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 USP48Q86UV5 1035 aa25.87■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.86■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.86■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 ADM5C9JUS6 153 aa25.85■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC102BQ68D86 513 aa25.85■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 DLK2Q6UY11 383 aa25.85■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 XAGE2Q96GT9 111 aa25.85■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 GRIK5Q16478 980 aa25.84■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 SULF1Q8IWU6 871 aa25.84■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.84■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 DLGAP5Q15398 846 aa25.83■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 CST9Q5W186 159 aa25.83■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.83■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.83■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.83■■□□□ 1.73
TMOD3-203ENST00000558455 SEMA3EO15041 775 aa25.82■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 CFAP100Q494V2 611 aa25.82■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.82■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.82■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 TNNI3KQ59H18 835 aa25.81■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.81■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 KLRG1Q96E93 195 aa25.81■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.81■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 GPR108Q9NPR9 543 aa25.81■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.81■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.8■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 HMMRO75330 724 aa25.8■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 SPDYE6P0CI01 402 aa25.8■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.8■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 RASGRF1Q13972 1273 aa25.8■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.8■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.8■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.8■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.79■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 ZBTB22O15209 634 aa25.79■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 GORABQ5T7V8 394 aa25.79■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.79■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 AOX1Q06278 1338 aa25.78■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 CRKP46108 304 aa25.77■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.77■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 CDCA5Q96FF9 252 aa25.77■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 CNTNAP1P78357 1384 aa25.77■■□□□ 1.72
TMOD3-203ENST00000558455 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.76■■□□□ 1.71
TMOD3-203ENST00000558455 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
TMOD3-203ENST00000558455 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.76■■□□□ 1.71
TMOD3-203ENST00000558455 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.76■■□□□ 1.71
TMOD3-203ENST00000558455 MAST3O60307 1309 aa25.75■■□□□ 1.71
TMOD3-203ENST00000558455 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
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