RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557183.1

FRMD6-216, Transcript of FERM domain containing 6, humanhuman

TSL 4

Gene FRMD6, Length 527 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6-216ENST00000557183 BNIP3LO60238 219 aa5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 PF4P02776 101 aa5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 GARTP22102 1010 aa5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 GRIA4P48058 902 aa5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 GPLD1P80108 840 aa5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 SDE2Q6IQ49 451 aa5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 TPTE2Q6XPS3 522 aa5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 TRPM4Q8TD43 1214 aa5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 BHMTQ93088 406 aa5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 STRN4Q9NRL3 753 aa5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 GINM1Q9NU53 330 aa5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 PHF24Q9UPV7 400 aa5.69□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 NFKBIEO00221 500 aa5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 FBXO24O75426 580 aa5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 SIK1P57059 783 aa5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 PTSQ03393 145 aa5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 SERINC3Q13530 473 aa5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 MAP3K11Q16584 847 aa5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 DBN1Q16643 649 aa5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 TTBK2Q6IQ55 1244 aa5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 SEC31BQ9NQW1 1179 aa5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 SAMM50Q9Y512 469 aa5.68□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 ENC1O14682 589 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 CELA3AP09093 270 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 PPP2R3AQ06190 1150 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 APOBRQ0VD83 1088 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 SPRED3Q2MJR0 410 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 RNFT1Q5M7Z0 435 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 FAM196AQ6ZSG2 479 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 LRP10Q7Z4F1 713 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 SLITRK4Q8IW52 837 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 GOLM1Q8NBJ4 401 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 CPLX3Q8WVH0 158 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 NKD1Q969G9 470 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 SLC30A3Q99726 388 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 PBX4Q9BYU1 374 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 ZNF576Q9H609 170 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 TLR6Q9Y2C9 796 aa5.67□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 F6X3S4 739 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 KLF4O43474 513 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 ARHGEF15O94989 841 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 SLURP2P0DP57 97 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 ACPPP15309 386 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 ETFBP38117 255 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 GRIN2CQ14957 1233 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 PCNX4Q63HM2 1172 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 ANKS3Q6ZW76 656 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 LRRC3Q9BY71 257 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 RBSNQ9H1K0 784 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 PRKAG3Q9UGI9 489 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 HCN2Q9UL51 889 aa5.66□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 METTL12A8MUP2 240 aa5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 CLSTN1O94985 981 aa5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 GHRHP01286 108 aa5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 CD33P20138 364 aa5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 LMNB1P20700 586 aa5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 RAB33AQ14088 237 aa5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 TNNI3KQ59H18 835 aa5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 CCDC155Q8N6L0 562 aa5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 ASAP3Q8TDY4 903 aa5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 TRIM55Q9BYV6 548 aa5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 UBP1Q9NZI7 540 aa5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 CYP8B1Q9UNU6 501 aa5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
FRMD6-216ENST00000557183 ZBTB42B2RXF5 422 aa5.64□□□□□ -1.51
FRMD6-216ENST00000557183 TRPA1O75762 1119 aa5.64□□□□□ -1.51
FRMD6-216ENST00000557183 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
FRMD6-216ENST00000557183 FGFR3P22607 806 aa5.64□□□□□ -1.51
FRMD6-216ENST00000557183 HSD3B2P26439 372 aa5.64□□□□□ -1.51
FRMD6-216ENST00000557183 FAAP100Q0VG06 881 aa5.64□□□□□ -1.51
FRMD6-216ENST00000557183 LRRC14Q15048 493 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms