RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
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SENP1-210ENST00000552189 PRDM1O75626 825 aa9.26□□□□□ -0.93
SENP1-210ENST00000552189 ZAP70P43403 619 aa9.26□□□□□ -0.93
SENP1-210ENST00000552189 CPXCR1Q8N123 301 aa9.26□□□□□ -0.93
SENP1-210ENST00000552189 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
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SENP1-210ENST00000552189 TTC22Q5TAA0 569 aa9.24□□□□□ -0.93
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SENP1-210ENST00000552189 ITPK1Q13572 414 aa9.23□□□□□ -0.93
SENP1-210ENST00000552189 C8orf76Q96K31 380 aa9.23□□□□□ -0.93
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SENP1-210ENST00000552189 LIG1P18858 919 aa9.23□□□□□ -0.93
SENP1-210ENST00000552189 NOD1Q9Y239 953 aa9.23□□□□□ -0.93
SENP1-210ENST00000552189 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.23□□□□□ -0.93
SENP1-210ENST00000552189 ZBTB43O43298 467 aa9.23□□□□□ -0.93
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SENP1-210ENST00000552189 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.23□□□□□ -0.93
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SENP1-210ENST00000552189 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
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SENP1-210ENST00000552189 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.23□□□□□ -0.93
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SENP1-210ENST00000552189 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
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SENP1-210ENST00000552189 APPBP2Q92624 585 aa9.22□□□□□ -0.93
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SENP1-210ENST00000552189 GPAA1O43292 621 aa9.22□□□□□ -0.93
SENP1-210ENST00000552189 PHKA1P46020 1223 aa9.22□□□□□ -0.93
SENP1-210ENST00000552189 NUCB1Q02818 461 aa9.22□□□□□ -0.93
SENP1-210ENST00000552189 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
SENP1-210ENST00000552189 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SENP1-210ENST00000552189 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.22□□□□□ -0.93
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