RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 CA12O43570 354 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB7AO95365 584 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 ZHX3Q9H4I2 956 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 JMYQ8N9B5 988 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.19□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 KIF5BP33176 963 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 PRPHP41219 470 aa7.18□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 HOMER1Q86YM7 354 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 SPC24Q8NBT2 197 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRB-210ENST00000551525 KDM4CQ9H3R0 1056 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 PICK1Q9NRD5 415 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 GGA1Q9UJY5 639 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 TTC37Q6PGP7 1564 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 UBXN2AP68543 259 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 DCAF15Q66K64 600 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRB-210ENST00000551525 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.16□□□□□ -1.26
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