RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 CSF1RP07333 972 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-227ENST00000551441 FLIIQ13045 1269 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-227ENST00000551441 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CS-227ENST00000551441 CFAP100Q494V2 611 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-227ENST00000551441 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CS-227ENST00000551441 WNK4Q96J92 1243 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-227ENST00000551441 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-227ENST00000551441 CENPFP49454 3210 aa20.59■□□□□ 0.89
CS-227ENST00000551441 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-227ENST00000551441 POTEFA5A3E0 1075 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-227ENST00000551441 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CS-227ENST00000551441 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.58■□□□□ 0.89
CS-227ENST00000551441 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
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CS-227ENST00000551441 A0A1B0GUL6 1792 aa20.57■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.57■□□□□ 0.88
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CS-227ENST00000551441 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.57■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.57■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 ALDH1A1P00352 501 aa20.56■□□□□ 0.88
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CS-227ENST00000551441 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 F6X3S4 739 aa20.55■□□□□ 0.88
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CS-227ENST00000551441 WWC1Q8IX03 1113 aa20.55■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 FOXO4P98177 505 aa20.54■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 CRHR2Q13324 411 aa20.54■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 MAP3K11Q16584 847 aa20.54■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 LINS1Q8NG48 757 aa20.54■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 MYO1BO43795 1136 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 SPDYE6P0CI01 402 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 CAP1Q01518 475 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 RASA3Q14644 834 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 ELP3Q9H9T3 547 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 IL1R1P14778 569 aa20.52■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 INHBEP58166 350 aa20.52■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.52■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.52■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.52■□□□□ 0.88
CS-227ENST00000551441 PTPN18Q99952 460 aa20.52■□□□□ 0.88
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CS-227ENST00000551441 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.51■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.51■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 OTOFQ9HC10 1997 aa20.5■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.5■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.5■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.5■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.5■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 OPTNQ96CV9 577 aa20.49■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 ERO1AQ96HE7 468 aa20.49■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 EFCC1Q9HA90 598 aa20.49■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.48■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 VAMP4O75379 141 aa20.48■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 GYG1P46976 350 aa20.48■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 CCDC27Q2M243 656 aa20.48■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 BEND3Q5T5X7 828 aa20.48■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.48■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.48■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 BRCA2P51587 3418 aa20.48■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 SP3Q02447 781 aa20.47■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.47■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.47■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 LAMB1P07942 1786 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 GRIK5Q16478 980 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.46■□□□□ 0.87
CS-227ENST00000551441 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.45■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 CACNA1FO60840 1977 aa20.45■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.44■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 IL16Q14005 1332 aa20.44■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.43■□□□□ 0.86
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