RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
SYF2P1-201ENST00000550658 RNF112Q9ULX5 631 aa4.78□□□□□ -1.64
SYF2P1-201ENST00000550658 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa4.78□□□□□ -1.64
SYF2P1-201ENST00000550658 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.77□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ZBTB39O15060 712 aa4.77□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 KIF4AO95239 1232 aa4.77□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 CEP135Q66GS9 1140 aa4.77□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 Q6ZS46 218 aa4.77□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 LACRTQ9GZZ8 138 aa4.77□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.77□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 RASSF4Q9H2L5 321 aa4.77□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 SLAIN2Q9P270 581 aa4.77□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 CARNS1A5YM72 827 aa4.76□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 LINC01387J3KSC0 135 aa4.76□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 GLB1P16278 677 aa4.76□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP2B4P23634 1241 aa4.76□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 CDC27P30260 824 aa4.76□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 RALBP1Q15311 655 aa4.76□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa4.76□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 TXNDC11Q6PKC3 985 aa4.76□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP4.76□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 GPATCH11Q8N954 259 aa4.76□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 GALNT11Q8NCW6 608 aa4.76□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM88BA6NKF7 163 aa4.75□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 FSTP19883 344 aa4.75□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC51AQ86UW1 340 aa4.75□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 NCAPG2Q86XI2 1143 aa4.75□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.75□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 PBX4Q9BYU1 374 aa4.75□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM63CQ9P1W3 806 aa4.75□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 SEPT3Q9UH03 358 aa4.75□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 TLDC2A0PJX2 215 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM177BA6PVY3 158 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 WISP1O95388 367 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 EPHA1P21709 976 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 CDC25BP30305 580 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 CD68P34810 354 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM117BQ6P1L5 589 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF662Q6ZS27 426 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ACAD11Q709F0 780 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF438Q7Z4V0 828 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ATCAYQ86WG3 371 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 SMC5Q8IY18 1101 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 CEP120Q8N960 986 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 KLHL23Q8NBE8 558 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ELP3Q9H9T3 547 aa4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 TM4SF5O14894 197 aa4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 FSCN2O14926 492 aa4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 PTPRAP18433 802 aa4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 TXKP42681 527 aa4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 HELQQ8TDG4 1101 aa4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 CARD10Q9BWT7 1032 aa4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 PCGF6Q9BYE7 350 aa4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 CEP41Q9BYV8 373 aa4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ADAM19Q9H013 955 aa4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 TERF2IPQ9NYB0 399 aa4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNK4Q9NYG8 393 aa4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 CNTN3Q9P232 1028 aa4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 KANSL3Q9P2N6 904 aa4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 RAXQ9Y2V3 346 aa4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 GSC2O15499 205 aa4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 DHX15O43143 795 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 MCCP23508 829 aa4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 PTPROQ16827 1216 aa4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 DUOXA2Q1HG44 320 aa4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 XKR5Q6UX68 686 aa4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ARMC10Q8N2F6 343 aa4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 EDEM1Q92611 657 aa4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 TANGO6Q9C0B7 1094 aa4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 SEC31BQ9NQW1 1179 aa4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 STOML1Q9UBI4 398 aa4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 SALL4Q9UJQ4 1053 aa4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa4.72□□□□□ -1.65
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKRD33BA6NCL7 494 aa4.71□□□□□ -1.66
SYF2P1-201ENST00000550658 H3BRJ5 948 aa4.71□□□□□ -1.66
SYF2P1-201ENST00000550658 ADAM11O75078 769 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms