RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 MPNDQ8N594 471 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 POLLQ9UGP5 575 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 DOCK2Q92608 1830 aa14.52□□□□□ -0.08
PTPRR-209ENST00000549308 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 LTBP1Q14766 1721 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 ADD2P35612 726 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 APPBP2Q92624 585 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 M0R2C6 588 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 PDE6AP16499 860 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 OLFM4Q6UX06 510 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 ABCF2Q9UG63 623 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 MAST3O60307 1309 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 DLEC1Q9Y238 1755 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 HSPA4P34932 840 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 BECN1Q14457 450 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 UBE3CQ15386 1083 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 OSBP2Q969R2 916 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 KIF2CQ99661 725 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 RAI14Q9P0K7 980 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 SLX4Q8IY92 1834 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 RIMBP2O15034 1052 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 ZBTB22O15209 634 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 MAP4K1Q92918 833 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 EYA3Q99504 573 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 A0A0G2JLW4 131 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 DPEP1P16444 411 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 ANAPC15P60006 121 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 RABEP1Q15276 862 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 TTLL6Q8N841 843 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 CD209Q9NNX6 404 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 PALD1Q9ULE6 856 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 G3V3G9 751 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 GPAA1O43292 621 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 TGFB2P61812 414 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 RNF20Q5VTR2 975 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 JAG2Q9Y219 1238 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 IL1R1P14778 569 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 CYP7A1P22680 504 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 NECTIN1Q15223 517 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 HSCBQ8IWL3 235 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 KLHL34Q8N239 644 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 AIDAQ96BJ3 306 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 COA1Q9GZY4 146 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRR-209ENST00000549308 SLC27A2O14975 620 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 C21orf2O43822 256 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 VPS53Q5VIR6 699 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 KCNA3P22001 575 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 SLC4A3P48751 1232 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 DOK7Q18PE1 504 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC93Q567U6 631 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 RASEFQ8IZ41 740 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 IL17RAQ96F46 866 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 ST18O60284 1047 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 MBD4O95243 580 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 KCNB2Q92953 911 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 SNX21Q969T3 373 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 PIM2Q9P1W9 311 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.43□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
PTPRR-209ENST00000549308 PRDX5P30044 214 aa14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms