RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547951.1

USP44-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, humanhuman

TSL 3

Gene USP44, Length 685 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44-204ENST00000547951 CCER2I3L3R5 266 aa27■■□□□ 1.91
USP44-204ENST00000547951 GYG1P46976 350 aa27■■□□□ 1.91
USP44-204ENST00000547951 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
USP44-204ENST00000547951 LRRC24Q50LG9 513 aa27■■□□□ 1.91
USP44-204ENST00000547951 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27■■□□□ 1.91
USP44-204ENST00000547951 SLC10A3P09131 477 aa26.99■■□□□ 1.91
USP44-204ENST00000547951 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.99■■□□□ 1.91
USP44-204ENST00000547951 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.99■■□□□ 1.91
USP44-204ENST00000547951 UBE2Q2LH0YL09 131 aa26.98■■□□□ 1.91
USP44-204ENST00000547951 RASAL3Q86YV0 1011 aa26.98■■□□□ 1.91
USP44-204ENST00000547951 CCDC102AQ96A19 550 aa26.98■■□□□ 1.91
USP44-204ENST00000547951 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
USP44-204ENST00000547951 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.97■■□□□ 1.91
USP44-204ENST00000547951 UBE4AQ14139 1066 aa26.96■■□□□ 1.91
USP44-204ENST00000547951 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 CA12O43570 354 aa26.94■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 MMP14P50281 582 aa26.94■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 FKBP1BP68106 108 aa26.94■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 DLGAP5Q15398 846 aa26.94■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 CFAP100Q494V2 611 aa26.94■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 FZD1Q9UP38 647 aa26.94■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.93■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.93■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 PRKG1Q13976 671 aa26.93■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.93■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 CSRNP1Q96S65 589 aa26.93■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.93■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.92■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 CLRN2A0PK11 232 aa26.92■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 METTL24Q5JXM2 366 aa26.92■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 MTMR14Q8NCE2 650 aa26.92■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 ABHD8Q96I13 439 aa26.92■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.91■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 SPDYE6P0CI01 402 aa26.91■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 GRIK5Q16478 980 aa26.91■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.9■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.9■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.9■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 RNF186Q9NXI6 227 aa26.9■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 TRPA1O75762 1119 aa26.89■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.89■■□□□ 1.9
USP44-204ENST00000547951 PDE8BO95263 885 aa26.88■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 NF2P35240 595 aa26.87■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 BCAMP50895 628 aa26.86■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 VEZTQ9HBM0 779 aa26.86■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 SAGE1Q9NXZ1 904 aa26.85■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 EYA2O00167 538 aa26.84■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 FGFR2P21802 821 aa26.84■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.84■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 VPS37DQ86XT2 251 aa26.84■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.84■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 LDLRAD1Q5T700 205 aa26.83■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
USP44-204ENST00000547951 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.82■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 MEIS3Q99687 375 aa26.82■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 SIL1Q9H173 461 aa26.82■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 TNNQ9UQP3 1299 aa26.82■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 MYO1BO43795 1136 aa26.81■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.81■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.81■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 CRKP46108 304 aa26.8■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 DGKZQ13574 1117 aa26.8■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 RASA3Q14644 834 aa26.8■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.8■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.8■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 MIER1Q8N108 512 aa26.8■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.8■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.79■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.79■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 OTOFQ9HC10 1997 aa26.77■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 CCDC85CA6NKD9 419 aa26.77■■□□□ 1.88
USP44-204ENST00000547951 KIF16BQ96L93 1317 aa26.76■■□□□ 1.87
USP44-204ENST00000547951 BCAR3O75815 825 aa26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms