RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547715.1

PTPRB-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-205ENST00000547715 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 MPHOSPH8Q99549 860 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 TMEM106CQ9BVX2 250 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 OTOFQ9HC10 1997 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 CLRN2A0PK11 232 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 UNCXA6NJT0 531 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 F8W031 263 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 CERS5Q8N5B7 392 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 VEZTQ9HBM0 779 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 CD209Q9NNX6 404 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 ITGA6P23229 1130 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 GJA5P36382 358 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 IREB2P48200 963 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 MTMR14Q8NCE2 650 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 PTPN18Q99952 460 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 NEURL1BA8MQ27 555 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 CAP1Q01518 475 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 CFAP100Q494V2 611 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 USP2O75604 605 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 SPDYE6P0CI01 402 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 CHRNDQ07001 517 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF333Q96JL9 665 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 A0A1B0GUL6 1792 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 H7C1W4 665 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 SNAP23O00161 211 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRB-205ENST00000547715 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 APAF1O14727 1248 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 TAF5LO75529 589 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 RASA3Q14644 834 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 NBPF11Q86T75 865 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 TSPYL6Q8N831 410 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 OPTNQ96CV9 577 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 STK31Q9BXU1 1019 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 ELP3Q9H9T3 547 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 AOX1Q06278 1338 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 MYCP01106 439 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 ARHGEF6Q15052 776 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 JAG2Q9Y219 1238 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 GCKRQ14397 625 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF804AQ7Z570 1209 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 PLA2G12BQ9BX93 195 aa18.56■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 IRS2Q9Y4H2 1338 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 CSF1RP07333 972 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 IL1R1P14778 569 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 MS4A4AQ96JQ5 239 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 TNFAIP1Q13829 316 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 G2E3Q7L622 706 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 H0YGN5 161 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 CCL15Q16663 113 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 BRI3BPQ8WY22 251 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 SLC4A2P04920 1241 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 GTF2A2P52657 109 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 CASP7P55210 303 aa18.52■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
PTPRB-205ENST00000547715 VGLL4Q14135 290 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 CDAN1Q8IWY9 1227 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 SH3TC2Q8TF17 1288 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 ARAP2Q8WZ64 1704 aa18.51■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 OTUD5Q96G74 571 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 CSADQ9Y600 493 aa18.5■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 TCP10L2B9ZVM9 353 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 PLIN1O60240 522 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 MAP3K9P80192 1104 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 KIF22Q14807 665 aa18.49■□□□□ 0.55
PTPRB-205ENST00000547715 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms