RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545450.6

MSLN-202, Transcript of mesothelin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSLN, Length 2,162 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLN-202ENST00000545450 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 TNMDQ9H2S6 317 aa22.12■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 DACT1Q9NYF0 836 aa22.12■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.11■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.11■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.11■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 SLC27A2O14975 620 aa22.11■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 NTSR2O95665 410 aa22.11■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 SYCP1Q15431 976 aa22.11■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.11■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.11■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 HIP1O00291 1037 aa22.1■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 ANKRD1Q15327 319 aa22.1■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.1■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 CASZ1Q86V15 1759 aa22.1■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 A0A1B0GUL7 405 aa22.09■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.09■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 ZNF75DP51815 510 aa22.09■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.09■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.09■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.09■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.09■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 C4BP0C0L5 1744 aa22.09■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 LRP5O75197 1615 aa22.09■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.09■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 FAM227BQ96M60 508 aa22.09■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 RPS6KA4O75676 772 aa22.08■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 KCNJ4P48050 445 aa22.08■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 LRMPQ12912 555 aa22.08■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.08■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 SPATA32Q96LK8 384 aa22.08■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 AK7Q96M32 723 aa22.08■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.08■■□□□ 1.13
MSLN-202ENST00000545450 SPEF2Q9C093 1822 aa22.08■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 GNPATO15228 680 aa22.08■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.08■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 FEZ1Q99689 392 aa22.08■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 FSD1Q9BTV5 496 aa22.08■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 C4AP0C0L4 1744 aa22.08■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.07■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.07■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 SMTNL1A8MU46 457 aa22.07■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.07■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.07■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.06■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 HAUS7Q99871 368 aa22.06■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 KIF20AO95235 890 aa22.06■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 RPS6KB1P23443 525 aa22.06■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 RNF20Q5VTR2 975 aa22.06■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 DRC7Q8IY82 874 aa22.06■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 TRIM5Q9C035 493 aa22.06■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
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MSLN-202ENST00000545450 ADORA1P30542 326 aa22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 CAVIN2O95810 425 aa22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 ZNF165P49910 485 aa22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 METTL24Q5JXM2 366 aa22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 PGBD1Q96JS3 809 aa22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 A0A0D9SFI3 127 aa22.03■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 NR1I2O75469 434 aa22.03■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 TNNT1P13805 278 aa22.03■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 CDC25BP30305 580 aa22.03■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.03■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 MED23Q9ULK4 1368 aa22.03■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 RGL2O15211 777 aa22.02■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 XAGE2Q96GT9 111 aa22.02■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.02■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.02■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 COL4A1P02462 1669 aa22.02■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.02■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.02■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 OGFRQ9NZT2 677 aa22.02■■□□□ 1.12
MSLN-202ENST00000545450 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.02■■□□□ 1.12
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