RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.96□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 SUCLG2Q96I99 432 aa6.96□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 CD209Q9NNX6 404 aa6.96□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.96□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.96□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.96□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 HTTP42858 3142 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF609O15014 1411 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 TAF5LO75529 589 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 CIAO1O76071 339 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 PDE8BO95263 885 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 CELF2O95319 508 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 IL1R1P14778 569 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 GTF2IP78347 998 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 NOGQ13253 232 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 SCARF1Q14162 830 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 DLGAP5Q15398 846 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 SLF2Q8IX21 1173 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 LPIN2Q92539 896 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC102AQ96A19 550 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 HOOK2Q96ED9 719 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 TMOD2Q9NZR1 351 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC37AA6NMS7 1700 aa6.95□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 CEP290O15078 2479 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 EYA2O00167 538 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAF5O00463 557 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 TNNI2P48788 182 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 DACT2Q5SW24 774 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 GORABQ5T7V8 394 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 ZIC5Q96T25 663 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF408Q9H9D4 720 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 BRCA2P51587 3418 aa6.94□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 CENPFP49454 3210 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 UNCXA6NJT0 531 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 SEMA3EO15041 775 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 SRGAP3O43295 1099 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 IGSF3O75054 1194 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 HMMRO75330 724 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM27P14373 513 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 USP48Q86UV5 1035 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 ITPRIPQ8IWB1 547 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 GMLQ99445 158 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 MRIQ9BWK5 157 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 GGA3Q9NZ52 723 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 BCAR3O75815 825 aa6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 HUNKP57058 714 aa6.92□□□□□ -1.3
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CLSTN3-215ENST00000544584 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP2B3Q16720 1220 aa6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 TEKT1Q969V4 418 aa6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 COPRSQ9NQ92 184 aa6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM205AQ6ZU69 1335 aa6.92□□□□□ -1.3
CLSTN3-215ENST00000544584 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
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