RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 SHTN1A0MZ66 631 aa22.7■■□□□ 1.22
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COPS7A-216ENST00000543170 AAMPQ13685 434 aa22.69■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.69■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 CRBNQ96SW2 442 aa22.69■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 MXD3Q9BW11 206 aa22.69■■□□□ 1.22
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COPS7A-216ENST00000543170 TIMM10P62072 90 aa22.68■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.68■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 TNNI3KQ59H18 835 aa22.68■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 OGFOD1Q8N543 542 aa22.68■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 CERS5Q8N5B7 392 aa22.68■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.68■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 XAGE2Q96GT9 111 aa22.68■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.68■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.68■■□□□ 1.22
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COPS7A-216ENST00000543170 CCDC102BQ68D86 513 aa22.67■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.67■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.67■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.67■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 PHKA1P46020 1223 aa22.66■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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COPS7A-216ENST00000543170 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.66■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.66■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 RAB11FIP3O75154 756 aa22.65■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 EGFRP00533 1210 aa22.65■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.65■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.64■■□□□ 1.22
COPS7A-216ENST00000543170 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.64■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.64■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.64■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.64■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 JAG2Q9Y219 1238 aa22.64■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.64■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.63■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.63■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 PASKQ96RG2 1323 aa22.62■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 HSPA6P17066 643 aa22.62■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
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COPS7A-216ENST00000543170 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.62■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
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COPS7A-216ENST00000543170 GORABQ5T7V8 394 aa22.61■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.61■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 MAST3O60307 1309 aa22.6■■□□□ 1.21
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COPS7A-216ENST00000543170 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.6■■□□□ 1.21
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COPS7A-216ENST00000543170 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.6■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.6■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 WNT10BO00744 389 aa22.59■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 GGA3Q9NZ52 723 aa22.59■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.59■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
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COPS7A-216ENST00000543170 SCARF1Q14162 830 aa22.58■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.58■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 DCTPP1Q9H773 170 aa22.58■■□□□ 1.21
COPS7A-216ENST00000543170 DLGAP5Q15398 846 aa22.57■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.57■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 AACSQ86V21 672 aa22.57■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 MRIQ9BWK5 157 aa22.57■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 APLP1P51693 650 aa22.56■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 CFAP100Q494V2 611 aa22.56■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.56■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.56■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.56■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.55■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 SPDYE6P0CI01 402 aa22.55■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 MCAMP43121 646 aa22.55■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 GRIK5Q16478 980 aa22.55■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.55■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 SPATA5Q8NB90 893 aa22.55■■□□□ 1.2
COPS7A-216ENST00000543170 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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