RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542133.5

NPIPB4-215, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 3

Gene NPIPB4, Length 910 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-215	ENST00000542133	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	10.05	□□□□□ -0.8	4e-9	■■□□□ 12.5
NPIPB4-215	ENST00000542133	SP3	Q02447	781 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	GSE1	Q14687	1217 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	FZD1	Q9UP38	647 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF428	Q96B54	188 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	WNK4	Q96J92	1243 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	CFAP53	Q96M91	514 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	USP17L3	A6NCW0	530 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	USP17L4	A6NCW7	530 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	SASH1	O94885	1247 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	NBPF11	Q86T75	865 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	SHISA4	Q96DD7	197 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZMYND15	Q9H091	742 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	GGA1	Q9UJY5	639 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	NUDC	Q9Y266	331 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133	OTOF	Q9HC10	1997 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NPIPB4-215	ENST00000542133		A0A1W2PPC1	479 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	MAP3K11	Q16584	847 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	IER5L	Q5T953	404 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	COPS6	Q7L5N1	327 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	FAM89A	Q96GI7	184 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	GJA5	P36382	358 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	DACT2	Q5SW24	774 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	PODN	Q7Z5L7	613 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	OGFOD1	Q8N543	542 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	DPF3	Q92784	378 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	LRCH3	Q96II8	777 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	PTPN18	Q99952	460 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	MXD3	Q9BW11	206 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		10	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		10	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		10	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	XDH	P47989	1333 aa		10	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		10	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	MED23	Q9ULK4	1368 aa		10	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	UNCX	A6NJT0	531 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	ARHGEF6	Q15052	776 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF592	Q92610	1267 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	VCAN	P13611	3396 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	PLCG2	P16885	1265 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	ATP2B4	P23634	1241 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	MMP14	P50281	582 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	MTFR1	Q15390	333 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	FBXW7	Q969H0	707 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	SPEF2	Q9C093	1822 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NPIPB4-215	ENST00000542133	NFE2L2	Q16236	605 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
NPIPB4-215	ENST00000542133	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NPIPB4-215	ENST00000542133	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NPIPB4-215	ENST00000542133	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NPIPB4-215	ENST00000542133	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NPIPB4-215	ENST00000542133	SPOCK2	Q92563	424 aa		9.96	□□□□□ -0.82

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