RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	SEMA3E	O15041	775 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	UBE3C	Q15386	1083 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	GPR162	Q16538	588 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	GYG1	P46976	350 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	KRT32	Q14532	448 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	XDH	P47989	1333 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	SLC27A2	O14975	620 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	ADD2	P35612	726 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		18.37	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	MAST3	O60307	1309 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	18.36	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	ALDH1B1	P30837	517 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	RASEF	Q8IZ41	740 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	OSBP2	Q969R2	916 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		18.36	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		18.35	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	CHGB	P05060	677 aa		18.35	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	NPR1	P16066	1061 aa		18.35	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	ATP2B4	P23634	1241 aa		18.35	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		18.34	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	COL4A1	P02462	1669 aa		18.34	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610		M0R2C6	588 aa		18.34	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	PDE6A	P16499	860 aa		18.34	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	TAF1	P21675	1872 aa		18.33	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		18.33	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		18.33	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		18.33	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		18.33	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	GGA1	Q9UJY5	639 aa		18.33	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	18.33	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ZBTB22	O15209	634 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	SP8	Q8IXZ3	490 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	AIDA	Q96BJ3	306 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	MASTL	Q96GX5	879 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ABCF2	Q9UG63	623 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		18.32	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	GPAA1	O43292	621 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	SRGN	P10124	158 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	RUFY3	Q7L099	469 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	RAI14	Q9P0K7	980 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	18.31	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	GPSM2	P81274	684 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	VPS53	Q5VIR6	699 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		18.31	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	IGSF3	O75054	1194 aa		18.3	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	UFL1	O94874	794 aa		18.3	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ANKRD1	Q15327	319 aa		18.3	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610		H0YIN7	160 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	NEK1	Q96PY6	1258 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		18.29	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610		A0A1B0GUL6	1792 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	APP	P05067	770 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	CYP21A2	P08686	494 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	GNAT2	P19087	354 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	KCNA3	P22001	575 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	TMX3	Q96JJ7	454 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	TTC14	Q96N46	770 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610		A0A0G2JLW4	131 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	CYP7A1	P22680	504 aa		18.28	■□□□□ 0.52
ATG13-222	ENST00000534610	KLRK1	P26718	216 aa		18.28	■□□□□ 0.52

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