RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 ARAP2Q8WZ64 1704 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRK-222ENST00000532751 FAM205AQ6ZU69 1335 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRK-222ENST00000532751 BCAMP50895 628 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRK-222ENST00000532751 TFCP2Q12800 502 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRK-222ENST00000532751 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRK-222ENST00000532751 PGAP2Q9UHJ9 254 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRK-222ENST00000532751 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
PTPRK-222ENST00000532751 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA0825Q8IV33 1275 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRK-222ENST00000532751 MYOZ2Q9NPC6 264 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRK-222ENST00000532751 JAG2Q9Y219 1238 aa27.16■■□□□ 1.94
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PTPRK-222ENST00000532751 PASKQ96RG2 1323 aa27.15■■□□□ 1.94
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PTPRK-222ENST00000532751 TRPM7Q96QT4 1865 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1B0GUL7 405 aa27.12■■□□□ 1.93
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PTPRK-222ENST00000532751 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
PTPRK-222ENST00000532751 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa27.12■■□□□ 1.93
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PTPRK-222ENST00000532751 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
PTPRK-222ENST00000532751 TIMM10P62072 90 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRK-222ENST00000532751 CDC37L1Q7L3B6 337 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRK-222ENST00000532751 NEUROD6Q96NK8 337 aa27.11■■□□□ 1.93
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PTPRK-222ENST00000532751 SCARF1Q14162 830 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRK-222ENST00000532751 XAGE2Q96GT9 111 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRK-222ENST00000532751 ADORA1P30542 326 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRK-222ENST00000532751 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRK-222ENST00000532751 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
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PTPRK-222ENST00000532751 GGA3Q9NZ52 723 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRK-222ENST00000532751 SEMA3EO15041 775 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 PHKA1P46020 1223 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 GORABQ5T7V8 394 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC102BQ68D86 513 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 ERC1Q8IUD2 1116 aa27.07■■□□□ 1.92
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PTPRK-222ENST00000532751 DENND2AQ9ULE3 1009 aa27.07■■□□□ 1.92
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PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB22O15209 634 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 HTRA3P83110 453 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 CFAP100Q494V2 611 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 TNNI3KQ59H18 835 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 MTMR14Q8NCE2 650 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP27.03■■□□□ 1.92
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PTPRK-222ENST00000532751 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 SERPINA10Q9UK55 444 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRK-222ENST00000532751 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 MYO1BO43795 1136 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP27.01■■□□□ 1.91
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PTPRK-222ENST00000532751 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.99■■□□□ 1.91
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PTPRK-222ENST00000532751 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa26.99■■□□□ 1.91
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PTPRK-222ENST00000532751 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 CRKP46108 304 aa26.98■■□□□ 1.91
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PTPRK-222ENST00000532751 GRIK5Q16478 980 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 RAB11FIP3O75154 756 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 TTC39AQ5SRH9 613 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 TEKT1Q969V4 418 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 CRBNQ96SW2 442 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRK-222ENST00000532751 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.97■■□□□ 1.91
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