RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 GNAI3P08754 354 aa23.28■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.28■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 COG6Q9Y2V7 657 aa23.28■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 SASH1O94885 1247 aa23.27■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.27■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.27■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 CCDC102AQ96A19 550 aa23.27■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.27■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.27■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.27■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 DGKZQ13574 1117 aa23.26■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.26■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 MOB2Q70IA6 237 aa23.26■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 COA1Q9GZY4 146 aa23.26■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.26■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 KCNJ4P48050 445 aa23.25■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.25■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.24■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 CHRNDQ07001 517 aa23.24■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.24■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.24■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 SNAP23O00161 211 aa23.23■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 TRPA1O75762 1119 aa23.23■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 GNAI2P04899 355 aa23.23■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.23■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.23■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 OGFOD1Q8N543 542 aa23.23■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.23■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.23■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 WNT10BO00744 389 aa23.22■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.22■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 RNF186Q9NXI6 227 aa23.22■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 MTX1Q13505 466 aa23.21■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.21■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.21■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.21■■□□□ 1.31
PUF60-218ENST00000531995 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.2■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 TAF5LO75529 589 aa23.2■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 FKBP1BP68106 108 aa23.2■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 GTF2IP78347 998 aa23.2■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.2■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 CSRNP1Q96S65 589 aa23.2■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.2■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.19■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.19■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.17■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.17■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 CD209Q9NNX6 404 aa23.17■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.17■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 ATP8B2P98198 1209 aa23.16■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 PRKG1Q13976 671 aa23.16■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.16■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 JAG2Q9Y219 1238 aa23.16■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 LRRC24Q50LG9 513 aa23.15■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.15■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 CERS5Q8N5B7 392 aa23.15■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 CRBNQ96SW2 442 aa23.15■■□□□ 1.3
PUF60-218ENST00000531995 F8W031 263 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 SRGAP3O43295 1099 aa23.14■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 NF2P35240 595 aa23.14■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.14■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 CEP85Q6P2H3 762 aa23.14■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 FZD1Q9UP38 647 aa23.14■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.14■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.14■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 OTOFQ9HC10 1997 aa23.13■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 POLA2Q14181 598 aa23.13■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.13■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 COPRSQ9NQ92 184 aa23.13■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.12■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.12■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 SSH3Q8TE77 659 aa23.12■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.11■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 LAMB1P07942 1786 aa23.1■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 EYA2O00167 538 aa23.1■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 DLGAP5Q15398 846 aa23.1■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 AOX1Q06278 1338 aa23.09■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 CLRN2A0PK11 232 aa23.09■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.09■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
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