RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529828.5

PTPRC-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 2,336 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-213ENST00000529828 TM4SF4P48230 202 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-213ENST00000529828 SREBF2Q12772 1141 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-213ENST00000529828 USP17L1Q7RTZ2 530 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-213ENST00000529828 ZNF687Q8N1G0 1237 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-213ENST00000529828 GCC1Q96CN9 775 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-213ENST00000529828 MYD88Q99836 296 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-213ENST00000529828 PODXL2Q9NZ53 605 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-213ENST00000529828 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-213ENST00000529828 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-213ENST00000529828 XDHP47989 1333 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 WNT10BO00744 389 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 KLRK1P26718 216 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 TMPOP42166 694 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 OTOP1Q7RTM1 612 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 RIC3Q7Z5B4 369 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 CD99L2Q8TCZ2 262 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 CLMNQ96JQ2 1002 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 NF2P35240 595 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 CAP1Q01518 475 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 CCDC152Q4G0S7 254 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 DACT2Q5SW24 774 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 SPRYD7Q5W111 196 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 ARMC9Q7Z3E5 817 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 TXNRD3Q86VQ6 643 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 KIAA0825Q8IV33 1275 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 ZNF609O15014 1411 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 CUL9Q8IWT3 2517 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 VCANP13611 3396 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 CHL1O00533 1208 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 PYGBP11216 843 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 ATP2B4P23634 1241 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 LMOD3Q0VAK6 560 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 DUSP27Q5VZP5 1158 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 OGFOD1Q8N543 542 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 PCDHB8Q9UN66 801 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 UNC80Q8N2C7 3258 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 SSC5DA1L4H1 1573 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 CLRN2A0PK11 232 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 F8W031 263 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 PDE8AO60658 829 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 CRHR2Q13324 411 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 PODNQ7Z5L7 613 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 SLC10A4Q96EP9 437 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 GREM2Q9H772 168 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 BABAM1Q9NWV8 329 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 HYPKQ9NX55 129 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 JAG2Q9Y219 1238 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 PTPN22Q9Y2R2 807 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 MED23Q9ULK4 1368 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 AOX1Q06278 1338 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 PSME4Q14997 1843 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 GJA5P36382 358 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 CCT4P50991 539 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 CTSWP56202 376 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 GTF2IP78347 998 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 LDLRAD1Q5T700 205 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 WNK4Q96J92 1243 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 DEFB129Q9H1M3 183 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 EFCC1Q9HA90 598 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 VEZTQ9HBM0 779 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 MBIPQ9NS73 344 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 MINPP1Q9UNW1 487 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 BOLA1Q9Y3E2 137 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 SPEF2Q9C093 1822 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 SNAP23O00161 211 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 ALDH1A1P00352 501 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 STRIP1Q5VSL9 837 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 ERO1AQ96HE7 468 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 H0YGN5 161 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 HOXB7P09629 217 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 GSE1Q14687 1217 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 DLGAP5Q15398 846 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-213ENST00000529828 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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