RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529558.1

AMBRA1-208, Transcript of autophagy and beclin 1 regulator 1, human

TSL 5

Gene AMBRA1, Length 483 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AMBRA1-208	ENST00000529558	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMBRA1-208	ENST00000529558	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMBRA1-208	ENST00000529558	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AMBRA1-208	ENST00000529558	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	FAM221A	A4D161	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	KIF4A	O95239	1232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	F13A1	P00488	732 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	MCM4	P33991	863 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	ZNF165	P49910	485 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	CASP7	P55210	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	FOXC1	Q12948	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	CCIN	Q13939	588 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	FXN	Q16595	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	C2orf27A	Q580R0	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	POTEG	Q6S5H5	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	NLRP8	Q86W28	1048 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	RNF217	Q8TC41	542 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	PLD4	Q96BZ4	506 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	HCST	Q9UBK5	93 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.9	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	PAGE1	O75459	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	TRIM37	O94972	964 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	SEPT6	Q14141	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	MPP2	Q14168	576 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	KANK3	Q6NY19	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	CEP120	Q8N960	986 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558		A0A096LPE4	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	NFKBIE	O00221	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	CILP	O75339	1184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	TRPA1	O75762	1119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	UPP2	O95045	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	GJB6	O95452	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	RARA	P10276	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	IMPDH2	P12268	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	ACPP	P15309	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	SOX18	P35713	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	HYAL2	Q12891	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	TCEA2	Q15560	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	MTERF2	Q49AM1	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	METTL12	A8MUP2	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	PSAP	P07602	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	RHOQ	P17081	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	SMPD1	P17405	629 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	LMNB1	P20700	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	BMP6	P22004	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	CLC	Q05315	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	GK5	Q6ZS86	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	CYP4X1	Q8N118	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	PSMD1	Q99460	953 aa		4.87	□□□□□ -1.63
AMBRA1-208	ENST00000529558	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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