RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526207.1

TXNRD1-210, Transcript of thioredoxin reductase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TXNRD1, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1-210ENST00000526207 RPS12P25398 132 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 SCARF1Q14162 830 aa9.56□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.55□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 VIL1P09327 827 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 ZNF609O15014 1411 aa9.55□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 ERBB4Q15303 1308 aa9.55□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.55□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 FKTNO75072 461 aa9.54□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 TM4SF4P48230 202 aa9.54□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 CAP1Q01518 475 aa9.54□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 PROX2Q3B8N5 592 aa9.54□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 TBC1D16Q8TBP0 767 aa9.54□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 NECTIN2Q92692 538 aa9.54□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 CFAP53Q96M91 514 aa9.54□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 OTOFQ9HC10 1997 aa9.54□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 PPP2R1AP30153 589 aa9.53□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 FKBP1BP68106 108 aa9.53□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 COPS6Q7L5N1 327 aa9.53□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 OTOP1Q7RTM1 612 aa9.53□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 XAGE3Q8WTP9 111 aa9.53□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 GMLQ99445 158 aa9.53□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 FZD1Q9UP38 647 aa9.53□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.53□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.53□□□□□ -0.88
TXNRD1-210ENST00000526207 BCAMP50895 628 aa9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 TCIRG1Q13488 830 aa9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 PRKG1Q13976 671 aa9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 TMC4Q7Z404 712 aa9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 ANKK1Q8NFD2 765 aa9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 FAM89AQ96GI7 184 aa9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 MYOZ2Q9NPC6 264 aa9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 NUDCQ9Y266 331 aa9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 TRIM17Q9Y577 477 aa9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 BRCA2P51587 3418 aa9.52□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 SZT2Q5T011 3432 aa9.51□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 COL9A1P20849 921 aa9.51□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 KRT24Q2M2I5 525 aa9.51□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 PLEKHF1Q96S99 279 aa9.51□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 EYA3Q99504 573 aa9.51□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 MXD3Q9BW11 206 aa9.51□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 PCGF6Q9BYE7 350 aa9.51□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.51□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 CLSPNQ9HAW4 1339 aa9.51□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 CEP290O15078 2479 aa9.5□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 CENPFP49454 3210 aa9.5□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 SSC5DA1L4H1 1573 aa9.5□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.5□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 UFL1O94874 794 aa9.5□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 PDE4AP27815 886 aa9.5□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.5□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 AGBL3Q8NEM8 1001 aa9.5□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 CD99L2Q8TCZ2 262 aa9.5□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.5□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 MYH3P11055 1940 aa9.49□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 SASH1O94885 1247 aa9.49□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 USP17L8P0C7I0 530 aa9.49□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 SREBF2Q12772 1141 aa9.49□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 NFE2L2Q16236 605 aa9.49□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 SPRYD7Q5W111 196 aa9.49□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.49□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.49□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 TSPYL4Q9UJ04 414 aa9.49□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 PTPN22Q9Y2R2 807 aa9.49□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 A0A1B0GUL6 1792 aa9.48□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 RPS8P62241 208 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 ARMC5Q96C12 935 aa9.48□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.47□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 H0YGN5 161 aa9.47□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 WNT10BO00744 389 aa9.47□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 LDLRAD1Q5T700 205 aa9.47□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 Q6ZNB5 142 aa9.47□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.47□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
TXNRD1-210ENST00000526207 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.6 ms