RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523839.5

RAD54B-208, Transcript of RAD54 homolog B, human

TSL 3

Gene RAD54B, Length 472 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD54B-208	ENST00000523839	CHRD	Q9H2X0	955 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	HMX2	A2RU54	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	PHACTR2	O75167	634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839		A6NHS1	94 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839		H3BRJ5	948 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	LINC01387	J3KSC0	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	NFKBIE	O00221	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	CABP4	P57796	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	CBLL1	Q75N03	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	CITED4	Q96RK1	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	ARID3A	Q99856	593 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAD54B-208	ENST00000523839		H3BRB1	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	TM4SF5	O14894	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	FSCN2	O14926	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	NEFL	P07196	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	ITGB5	P18084	799 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	EPHA1	P21709	976 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	EREG	O14944	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	NDUFB5	O43674	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	SERPINB4	P48594	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	PDE3B	Q13370	1112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	ECM1	Q16610	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	NXPE3	Q969Y0	559 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	OSMR	Q99650	979 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	WISP1	O95388	367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	ACPP	P15309	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	ARL4D	P49703	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	PRNP	P04156	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	FAM129B	Q96TA1	746 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	DBX1	A6NMT0	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	WDR64	B1ANS9	1081 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	BRD1	O95696	1058 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	CDC25B	P30305	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAD54B-208	ENST00000523839	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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