RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522469.5

RBM22-208, Transcript of RNA binding motif protein 22, human

TSL 2

Gene RBM22, Length 989 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM22-208	ENST00000522469	SMARCA4	P51532	1647 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	TM4SF5	O14894	197 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	WISP1	O95388	367 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	ARL4D	P49703	201 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	CEP41	Q9BYV8	373 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	FAM129B	Q96TA1	746 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	EEA1	Q15075	1411 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	ADAM11	O75078	769 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	BRD1	O95696	1058 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	IKBKE	Q14164	716 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	UVSSA	Q2YD98	709 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469		Q8N3U1	123 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	NLRP12	P59046	1061 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	TMC1	Q8TDI8	760 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		7.41	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	RNF208	Q9H0X6	261 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM22-208	ENST00000522469	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469		A0A1W2PP55	124 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	GPR182	O15218	404 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	ORC1	Q13415	861 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	CCNJL	Q8IV13	435 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	RAX	Q9Y2V3	346 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	SMARCA2	P51531	1590 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	SLC51A	Q86UW1	340 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469		A0A096LPE4	126 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469		A0A1W2PPZ6	126 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	METTL12	A8MUP2	240 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	FST	P19883	344 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	XP32	Q5T750	250 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	FDX2	Q6P4F2	183 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	TCF12	Q99081	682 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	USP26	Q9BXU7	913 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	NPHS2	Q9NP85	383 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	GSC2	O15499	205 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	IGHA2	P01877	340 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	PCDH1	Q08174	1060 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	MYRFL	Q96LU7	910 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	EHD4	Q9H223	541 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	MEGF11	A6BM72	1044 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	GRIA4	P48058	902 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	GSTM4	Q03013	218 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	STOML1	Q9UBI4	398 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	PREP	P48147	710 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	LRP8	Q14114	963 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	ARTN	Q5T4W7	220 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	CSRNP1	Q96S65	589 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		7.34	□□□□□ -1.23

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