RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 TMCO3Q6UWJ1 677 aa19.89■□□□□ 0.78
PTDSS1-202ENST00000517309 KIAA0754O94854 1291 aa19.89■□□□□ 0.78
PTDSS1-202ENST00000517309 TIMM10P62072 90 aa19.89■□□□□ 0.78
PTDSS1-202ENST00000517309 LPIN2Q92539 896 aa19.89■□□□□ 0.78
PTDSS1-202ENST00000517309 GCKRQ14397 625 aa19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 APPBP2Q92624 585 aa19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM87BQ96K49 555 aa19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 KRT13P13646 458 aa19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 ATL3Q6DD88 541 aa19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 EHBP1Q8NDI1 1231 aa19.89■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC102AQ96A19 550 aa19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 USP19O94966 1318 aa19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 APOBRQ0VD83 1088 aa19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 SUPT20HQ8NEM7 779 aa19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 ADCY5O95622 1261 aa19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 AFMP43652 599 aa19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 XAGE2Q96GT9 111 aa19.88■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 MAGI2Q86UL8 1455 aa19.87■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 PTPDC1A2A3K4 754 aa19.87■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM193AP78312 1265 aa19.87■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 ASIC1P78348 528 aa19.87■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 SPAG5Q96R06 1193 aa19.87■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 CNPY2Q9Y2B0 182 aa19.87■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 LRSAM1Q6UWE0 723 aa19.87■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 TAOK3Q9H2K8 898 aa19.87■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 MROH5Q6ZUA9 1318 aa19.87■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 C8orf34Q49A92 452 aa19.87■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 DBNDD2Q9BQY9 259 aa19.87■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 H0YIN7 160 aa19.86■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 TBC1D5Q92609 795 aa19.86■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 YEATS2Q9ULM3 1422 aa19.86■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 AKR1B10O60218 316 aa19.86■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 CTNNA2P26232 953 aa19.86■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 USP48Q86UV5 1035 aa19.86■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 ERBB4Q15303 1308 aa19.86■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 PDE6BP35913 854 aa19.86■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 ISM2Q6H9L7 571 aa19.86■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 USP26Q9BXU7 913 aa19.86■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa19.86■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa19.85■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 GIMAP6Q6P9H5 292 aa19.85■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 HOOK3Q86VS8 718 aa19.85■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM200AQ8TCP9 573 aa19.85■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 HOOK2Q96ED9 719 aa19.85■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 KIF24Q5T7B8 1368 aa19.85■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 UBASH3AP57075 661 aa19.85■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa19.85■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 DACT1Q9NYF0 836 aa19.85■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 POTEB2H3BUK9 544 aa19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 TNNT1P13805 278 aa19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 GLT8D2Q9H1C3 349 aa19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 RTL1A6NKG5 1358 aa19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 TMCO5BA8MYB1 307 aa19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 RBM10P98175 930 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 CHST3Q7LGC8 479 aa19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 NOP2P46087 812 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 KBTBD3Q8NAB2 608 aa19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 FLAD1Q8NFF5 587 aa19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 SUCLG2Q96I99 432 aa19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 PLVAPQ9BX97 442 aa19.84■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa19.83■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 ADGBQ8N7X0 1667 aa19.83■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 MACROD2A1Z1Q3 448 aa19.83■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 TCIRG1Q13488 830 aa19.83■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 DTHD1Q6ZMT9 781 aa19.83■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 DRC1Q96MC2 740 aa19.83■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 FERMT1Q9BQL6 677 aa19.83■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 PLS1Q14651 629 aa19.83■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa19.83■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 EFCAB6Q5THR3 1501 aa19.83■□□□□ 0.77
PTDSS1-202ENST00000517309 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 PHKG2P15735 406 aa19.83■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 MBD5Q9P267 1494 aa19.83■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 HS2ST1Q7LGA3 356 aa19.82■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP19.82■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 DHX58Q96C10 678 aa19.82■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa19.82■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 JAG2Q9Y219 1238 aa19.82■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 BICDL2A1A5D9 508 aa19.82■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 ALDH1B1P30837 517 aa19.82■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 PPP2R5BQ15173 497 aa19.82■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 IQUBQ8NA54 791 aa19.82■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 IMPG2Q9BZV3 1241 aa19.82■□□□□ 0.76
PTDSS1-202ENST00000517309 TAF3Q5VWG9 929 aa19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms