RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516724.1

RNU6-572P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 572, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-572P, Length 80 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-572P-201ENST00000516724 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 FCHSD1Q86WN1 690 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 SPATA32Q96LK8 384 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 TMEM74Q96NL1 305 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 GMLQ99445 158 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 TANGO6Q9C0B7 1094 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 MUC3BQ9H195 1237 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 COPRSQ9NQ92 184 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 TMEM39AQ9NV64 488 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 GGA1Q9UJY5 639 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 NAGPAQ9UK23 515 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 SOX13Q9UN79 622 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 ENC1O14682 589 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 B3GALT4O96024 378 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 CELA3AP09093 270 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 TNNI2P48788 182 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 LIG3P49916 1009 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 CABP4P57796 275 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 ARID5AQ03989 594 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 PCDH1Q08174 1060 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 KANK3Q6NY19 840 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 KIAA0825Q8IV33 1275 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 RASGRP4Q8TDF6 673 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 ARMC5Q96C12 935 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 RHOVQ96L33 236 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 SPON2Q9BUD6 331 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-572P-201ENST00000516724 MINDY4BA8MYZ0 360 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 TERTO14746 1132 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 ATP2B1P20020 1258 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 LMNB1P20700 586 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 CDC27P30260 824 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 LMNB2Q03252 620 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 FAAP100Q0VG06 881 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 PAK2Q13177 524 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 MAP3K11Q16584 847 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 AGMOQ6ZNB7 445 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 VN1R5Q7Z5H4 357 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 PHC3Q8NDX5 983 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 IRF7Q92985 503 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 GPRASP2Q96D09 838 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 LACRTQ9GZZ8 138 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 KCNQ5Q9NR82 932 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 TRIM33Q9UPN9 1127 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 H3BRJ5 948 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 EPXP11678 715 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 NME2P22392 152 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 IKBKEQ14164 716 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 LRRC14Q15048 493 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 RNFT1Q5M7Z0 435 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 PCNX4Q63HM2 1172 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 SCARA3Q6AZY7 606 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF787Q6DD87 383 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 NT5C1AQ9BXI3 368 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 LRRC4BQ9NT99 713 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 CYP8B1Q9UNU6 501 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 ROBO2Q9HCK4 1378 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 PF4P02776 101 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 EPHA1P21709 976 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 AP3B2Q13367 1082 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 GRIK5Q16478 980 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF423Q2M1K9 1284 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 SNAP47Q5SQN1 464 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 FAM117BQ6P1L5 589 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 C20orf204Q6ZNR8 217 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 TRIM42Q8IWZ5 723 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 NUDT8Q8WV74 236 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 WNT8BQ93098 351 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 SEC16BQ96JE7 1060 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 TLR6Q9Y2C9 796 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 F6X3S4 739 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-572P-201ENST00000516724 GREM1O60565 184 aa4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.3 ms