RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 FBF1Q8TES7 1133 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-225ENST00000515835 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-225ENST00000515835 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-225ENST00000515835 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1W2PP55 124 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 NFKBIEO00221 500 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 GNB5O14775 395 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 NID1P14543 1247 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 ACPPP15309 386 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 FGD1P98174 961 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 CEP135Q66GS9 1140 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 ASXL2Q76L83 1435 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 NPHS2Q9NP85 383 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 KIAA0556O60303 1618 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 GLI2P10070 1586 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 EEA1Q15075 1411 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 NXPE3Q969Y0 559 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 PTPRAP18433 802 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 MSL1Q68DK7 614 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 ADAM19Q9H013 955 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 TRPA1O75762 1119 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 IRS1P35568 1242 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 TRIM11Q96F44 468 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 MUC3BQ9H195 1237 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 EHD4Q9H223 541 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 BAG6P46379 1132 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 ILDR2Q71H61 639 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 CCNJLQ8IV13 435 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 HHIPQ96QV1 700 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 FAM177BA6PVY3 158 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 CDC27P30260 824 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 SETDB2Q96T68 719 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 TCF12Q99081 682 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 PLVAPQ9BX97 442 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDE4D-225ENST00000515835 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.9□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 KDM6BO15054 1643 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 BSNDQ8WZ55 320 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 FRMD6Q96NE9 622 aa9.89□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 GIPC1O14908 333 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 GRM2Q14416 872 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 PI16Q6UXB8 463 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 DTWD1Q8N5C7 304 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 SPG7Q9UQ90 795 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 ABCA8O94911 1581 aa9.88□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 BCO2Q9BYV7 579 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 PPP4R2Q9NY27 417 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 SOX13Q9UN79 622 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 PPME1Q9Y570 386 aa9.87□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 CABP4P57796 275 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 RAC1P63000 192 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 A0A096LPE4 126 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 A0A1W2PPZ6 126 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 GNA15P30679 374 aa9.85□□□□□ -0.83
PDE4D-225ENST00000515835 GRIA4P48058 902 aa9.85□□□□□ -0.83
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