RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT85	P78386	507 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	MLEC	Q14165	292 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	RETREG3	Q86VR2	466 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	BANK1	Q8NDB2	785 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PRR7	Q8TB68	274 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF516	Q92618	1163 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	EVI5L	Q96CN4	794 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	KAZALD1	Q96I82	304 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	SPSB2	Q99619	263 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	IL21	Q9HBE4	155 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CBX8	Q9HC52	389 aa		5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM177B	A6PVY3	158 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CFAP99	D6REC4	459 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	HIP1	O00291	1037 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNQ3	O43525	872 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	AP1G2	O75843	785 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PSMA5	P28066	241 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	REST	Q13127	1097 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD1	Q15327	319 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	SARM1	Q6SZW1	724 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	IP6K1	Q92551	441 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	GPATCH3	Q96I76	525 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PGBD1	Q96JS3	809 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM227B	Q96M60	508 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	LGR6	Q9HBX8	967 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		5.88	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A0D9SFI3	127 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	SMTNL1	A8MU46	457 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	DTNB	O60941	627 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	TAF5L	O75529	589 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	SASH1	O94885	1247 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CAVIN2	O95810	425 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	LRMP	Q12912	555 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	IQCB1	Q15051	598 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PROSER3	Q2NL68	480 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	KSR2	Q6VAB6	950 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	AACS	Q86V21	672 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	LUZP1	Q86V48	1076 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	SPC24	Q8NBT2	197 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	FEZ1	Q99689	392 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	KCND1	Q9NSA2	647 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	DACT1	Q9NYF0	836 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		5.87	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	COL15A1	P39059	1388 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ANXA1	P04083	346 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	DESI1	Q6ICB0	168 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	FERMT3	Q86UX7	667 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	LINS1	Q8NG48	757 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	GTF3C6	Q969F1	213 aa		5.86	□□□□□ -1.47

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