RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	GPR152	Q8TDT2	470 aa		10.33	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552		E9PCH4	1651 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	PCSK2	P16519	638 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	NEUROD1	Q13562	356 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	CCIN	Q13939	588 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC30A3	Q99726	388 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	GSX2	Q9BZM3	304 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	USP20	Q9Y2K6	914 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		10.32	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	PIK3R4	Q99570	1358 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	FZD6	O60353	706 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAMTS2	O95450	1211 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	SLURP2	P0DP57	97 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	ARAF	P10398	606 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	GRIN2C	Q14957	1233 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	EDEM1	Q92611	657 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		10.31	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	MSH6	P52701	1360 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	XYLB	O75191	536 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	PDGFA	P04085	211 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	10.3	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	USP5	P45974	858 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	PNMA5	Q96PV4	448 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	POLI	Q9UNA4	740 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	TBX22	Q9Y458	520 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	TRPM2	O94759	1503 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	NDUFB5	O43674	189 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	SIN3B	O75182	1162 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	ADH6	P28332	368 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	10.27	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	SYT9	Q86SS6	491 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	TTC16	Q8NEE8	873 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	BHMT	Q93088	406 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	CITED4	Q96RK1	184 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	DCC	P43146	1447 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	MAP3K6	O95382	1288 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	ACD	Q96AP0	544 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		10.26	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	SASH3	O75995	380 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	NFKB1	P19838	968 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	EHHADH	Q08426	723 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	XKR5	Q6UX68	686 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	NLRP13	Q86W25	1043 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	GJD3	Q8N144	294 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	KLF15	Q9UIH9	416 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	NUP155	O75694	1391 aa		10.25	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	PHLPP1	O60346	1717 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	GGA1	Q9UJY5	639 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	JCAD	Q9P266	1359 aa		10.24	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	RARA	P10276	462 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	C8orf34	Q49A92	452 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	ZFAT	Q9P243	1243 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		10.23	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	BCR	P11274	1271 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	PDE3B	Q13370	1112 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	TNFRSF25	Q93038	417 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	SHPRH	Q149N8	1683 aa		10.22	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		10.21	□□□□□ -0.77
PDE4D-222	ENST00000514552	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77

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