RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 BCAMP50895 628 aa16.46■□□□□ 0.23
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PGGT1B-204ENST00000503638 PODNQ7Z5L7 613 aa16.46■□□□□ 0.23
PGGT1B-204ENST00000503638 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PGGT1B-204ENST00000503638 XAGE2Q96GT9 111 aa16.46■□□□□ 0.23
PGGT1B-204ENST00000503638 CD209Q9NNX6 404 aa16.46■□□□□ 0.23
PGGT1B-204ENST00000503638 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
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PGGT1B-204ENST00000503638 POTEJP0CG39 1038 aa16.45■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 GTF2IP78347 998 aa16.45■□□□□ 0.22
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PGGT1B-204ENST00000503638 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
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PGGT1B-204ENST00000503638 DCTPP1Q9H773 170 aa16.45■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNQ5Q9NR82 932 aa16.45■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
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PGGT1B-204ENST00000503638 USP17L4A6NCW7 530 aa16.44■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 PSMD14O00487 310 aa16.44■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16.44■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 GPC2Q8N158 579 aa16.44■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.43■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.43■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 TTLL5Q6EMB2 1281 aa16.43■□□□□ 0.22
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PGGT1B-204ENST00000503638 GPR108Q9NPR9 543 aa16.43■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 IRS2Q9Y4H2 1338 aa16.43■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 IL1R1P14778 569 aa16.42■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 PHKA1P46020 1223 aa16.42■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD45Q5TZF3 282 aa16.42■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC102BQ68D86 513 aa16.42■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.42■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
PGGT1B-204ENST00000503638 GCC1Q96CN9 775 aa16.42■□□□□ 0.22
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PGGT1B-204ENST00000503638 STRIP1Q5VSL9 837 aa16.4■□□□□ 0.22
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PGGT1B-204ENST00000503638 KIAA0825Q8IV33 1275 aa16.38■□□□□ 0.21
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PGGT1B-204ENST00000503638 RASGRF1Q13972 1273 aa16.37■□□□□ 0.21
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PGGT1B-204ENST00000503638 USP17L8P0C7I0 530 aa16.36■□□□□ 0.21
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PGGT1B-204ENST00000503638 GPRC5DQ9NZD1 345 aa16.36■□□□□ 0.21
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PGGT1B-204ENST00000503638 EPS15P42566 896 aa16.35■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 SCNN1DP51172 638 aa16.35■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
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PGGT1B-204ENST00000503638 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.35■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 MYH13Q9UKX3 1938 aa16.35■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 SHTN1A0MZ66 631 aa16.34■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 EPHX2P34913 555 aa16.34■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 SCARF1Q14162 830 aa16.34■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 SMC5Q8IY18 1101 aa16.34■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 CERS5Q8N5B7 392 aa16.34■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 DPF2Q92785 391 aa16.34■□□□□ 0.21
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
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