RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492338.2

TNS1-218, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNS1, Length 957 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-218ENST00000492338 TTLL5Q6EMB2 1281 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-218ENST00000492338 SMYD5Q6GMV2 418 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-218ENST00000492338 ZNF804AQ7Z570 1209 aa12.97□□□□□ -0.33
TNS1-218ENST00000492338 COL4A1P02462 1669 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-218ENST00000492338 TRAF5O00463 557 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-218ENST00000492338 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TNS1-218ENST00000492338 DEFB115Q30KQ5 88 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-218ENST00000492338 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TNS1-218ENST00000492338 TXNRD3Q86VQ6 643 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-218ENST00000492338 FBXO22Q8NEZ5 403 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-218ENST00000492338 ARHGAP45Q92619 1136 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-218ENST00000492338 KAZALD1Q96I82 304 aa12.96□□□□□ -0.33
TNS1-218ENST00000492338 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TNS1-218ENST00000492338 MROH5Q6ZUA9 1318 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 MYO3BQ8WXR4 1341 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 CELF2O95319 508 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 MMP14P50281 582 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 GTF2IP78347 998 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 UBE4AQ14139 1066 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 KRT26Q7Z3Y9 468 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 USP48Q86UV5 1035 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 ZNF408Q9H9D4 720 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 CD209Q9NNX6 404 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 HDAC9Q9UKV0 1011 aa12.95□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 SNAP23O00161 211 aa12.94□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 KLRK1P26718 216 aa12.94□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 SCARF1Q14162 830 aa12.94□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 METTL24Q5JXM2 366 aa12.94□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 DACT2Q5SW24 774 aa12.94□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 SULF1Q8IWU6 871 aa12.94□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 ANKRD44Q8N8A2 993 aa12.94□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 GMLQ99445 158 aa12.94□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 MYOZ2Q9NPC6 264 aa12.94□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 VPS37DQ86XT2 251 aa12.93□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa12.93□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 CNTNAP1P78357 1384 aa12.93□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 MYH3P11055 1940 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 RASSF10A6NK89 507 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 PITPNM1O00562 1244 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 EGFRP00533 1210 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 GNAI3P08754 354 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 ECE1P42892 770 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 VEGFBP49765 207 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 LTBP1Q14766 1721 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 CAVIN4Q5BKX8 364 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 CST9Q5W186 159 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 EFCAB3Q8N7B9 438 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 MXD3Q9BW11 206 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 GGA3Q9NZ52 723 aa12.92□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 BCAR3O75815 825 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 IL1R1P14778 569 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 GRM1Q13255 1194 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 LRRC24Q50LG9 513 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 KIAA0825Q8IV33 1275 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 C2orf69Q8N8R5 385 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 TLL2Q9Y6L7 1015 aa12.91□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 EYA2O00167 538 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 SASH1O94885 1247 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 PDE8BO95263 885 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 GYG1P46976 350 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 KLHDC4Q8TBB5 520 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 AIDAQ96BJ3 306 aa12.9□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
TNS1-218ENST00000492338 ZBED9Q6R2W3 1325 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 ZNF609O15014 1411 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 DLGAP5Q15398 846 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 CLUAP1Q96AJ1 413 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 CAPNS2Q96L46 248 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 CEP126Q9P2H0 1117 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa12.89□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 ADM5C9JUS6 153 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 F8W031 263 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 TRIM27P14373 513 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 NBPF9Q3BBW0 867 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 SAPCD2Q86UD0 394 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 MEIS3Q99687 375 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 BEGAINQ9BUH8 593 aa12.88□□□□□ -0.35
TNS1-218ENST00000492338 SIL1Q9H173 461 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms