RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491123.5

SUCLG1-208, Transcript of succinate-CoA ligase alpha subunit, human

TSL 3

Gene SUCLG1, Length 1,073 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLG1-208	ENST00000491123	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	COL19A1	Q14993	1142 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	TIAF1	O95411	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ABTB2	Q8N961	1025 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	RXRB	P28702	533 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ATCAY	Q86WG3	371 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	DLGAP3	O95886	979 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	XKR5	Q6UX68	686 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	CES1	P23141	567 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARL4D	P49703	201 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SUCLG1-208	ENST00000491123	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	FBXL18	Q96ME1	805 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		11.14	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	C8A	P07357	584 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	ITGB5	P18084	799 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	ADM	P35318	185 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	NFKBIB	Q15653	356 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	NXPE3	Q969Y0	559 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	DRD2	P14416	443 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	ASIC4	Q96FT7	647 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	IKBKE	Q14164	716 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	PAOX	Q6QHF9	649 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	BSND	Q8WZ55	320 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	USP26	Q9BXU7	913 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLAIN2	Q9P270	581 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	SEPT3	Q9UH03	358 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123		A6NHS1	94 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	CYP26A1	O43174	497 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	EDEM1	Q92611	657 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SUCLG1-208	ENST00000491123	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZAR1	Q86SH2	424 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	GATA6	Q92908	595 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	OSMR	Q99650	979 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	USP11	P51784	963 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	PMEPA1	Q969W9	287 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	ATG7	O95352	703 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM170B	A6NMN3	283 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	PDGFA	P04085	211 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	11.03	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	C8orf34	Q49A92	452 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	FLCN	Q8NFG4	579 aa		11.03	□□□□□ -0.64
SUCLG1-208	ENST00000491123	EREG	O14944	169 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		11.02	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		11.01	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	PCSK2	P16519	638 aa		11	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	LCE4A	Q5TA78	99 aa		11	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	PAPLN	O95428	1278 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	GSTM4	Q03013	218 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		10.99	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	ATP2B4	P23634	1241 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		10.98	□□□□□ -0.65
SUCLG1-208	ENST00000491123	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		10.98	□□□□□ -0.65

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