RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490669.1

JMJD1C-208, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene JMJD1C, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-208ENST00000490669 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.35□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.35□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 DEFB132Q7Z7B7 95 aa8.35□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.35□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 PROCP04070 461 aa8.34□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 ATP4AP20648 1035 aa8.34□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 AMPD1P23109 780 aa8.34□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 CTBSQ01459 385 aa8.34□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.34□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 KRT27Q7Z3Y8 459 aa8.34□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.34□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 AIDAQ96BJ3 306 aa8.34□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.34□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 GGA1Q9UJY5 639 aa8.34□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.34□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.34□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.34□□□□□ -1.07
JMJD1C-208ENST00000490669 PAPPAQ13219 1627 aa8.33□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 SMTNP53814 917 aa8.33□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 CRB1P82279 1406 aa8.33□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 FLIIQ13045 1269 aa8.33□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 SEMA3FQ13275 785 aa8.33□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 CABP1Q9NZU7 370 aa8.33□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 BTAF1O14981 1849 aa8.33□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.33□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 USP31Q70CQ4 1352 aa8.33□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.32□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 ADAM23O75077 832 aa8.32□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 GCP02774 474 aa8.32□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 MCM6Q14566 821 aa8.32□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM182BQ5T319 152 aa8.32□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.32□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.32□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 QSER1Q2KHR3 1735 aa8.32□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.31□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 KRBA1A5PL33 1030 aa8.31□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 COL8A1P27658 744 aa8.31□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 SOX11P35716 441 aa8.31□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 NLRP8Q86W28 1048 aa8.31□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 ABTB2Q8N961 1025 aa8.31□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 EVC2Q86UK5 1308 aa8.3□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 BCL9O00512 1426 aa8.3□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 LY75O60449 1722 aa8.3□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.3□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.3□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 ARAFP10398 606 aa8.3□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.3□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 TESK2Q96S53 571 aa8.3□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A1W2PP64 1363 aa8.3□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A1W2PNR3 127 aa8.29□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.29□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 EPXP11678 715 aa8.29□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 NEUROD1Q13562 356 aa8.29□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 GRIN2CQ14957 1233 aa8.29□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.29□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.29□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 NLRP13Q86W25 1043 aa8.29□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.29□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.29□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.29□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 A6NJY4 79 aa8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 PIK3R2O00459 728 aa8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 AAMPQ13685 434 aa8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 MTFR1Q15390 333 aa8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 BTBD6Q96KE9 485 aa8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 STRN4Q9NRL3 753 aa8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 TNS2Q63HR2 1409 aa8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.28□□□□□ -1.08
JMJD1C-208ENST00000490669 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.27□□□□□ -1.09
JMJD1C-208ENST00000490669 PKD1L3Q7Z443 1732 aa8.27□□□□□ -1.09
JMJD1C-208ENST00000490669 PIK3CDO00329 1044 aa8.27□□□□□ -1.09
JMJD1C-208ENST00000490669 CDK2AP1O14519 115 aa8.27□□□□□ -1.09
JMJD1C-208ENST00000490669 GNB5O14775 395 aa8.27□□□□□ -1.09
JMJD1C-208ENST00000490669 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
JMJD1C-208ENST00000490669 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
JMJD1C-208ENST00000490669 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.27□□□□□ -1.09
JMJD1C-208ENST00000490669 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.27□□□□□ -1.09
JMJD1C-208ENST00000490669 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
JMJD1C-208ENST00000490669 USP3Q9Y6I4 520 aa8.27□□□□□ -1.09
JMJD1C-208ENST00000490669 TONSLQ96HA7 1378 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms