RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.63■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.63■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 CLRN2A0PK11 232 aa21.62■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 FOXO4P98177 505 aa21.62■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.62■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.61■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 VAMP4O75379 141 aa21.61■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 MAP3K11Q16584 847 aa21.61■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 CFAP100Q494V2 611 aa21.61■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.61■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.61■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 JAG2Q9Y219 1238 aa21.61■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 F6X3S4 739 aa21.6■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 ALDH1A1P00352 501 aa21.6■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 IL1R1P14778 569 aa21.6■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.6■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 IFNL1Q8IU54 200 aa21.6■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.6■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 MYO1BO43795 1136 aa21.59■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 PLIN1O60240 522 aa21.59■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 INHBEP58166 350 aa21.59■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 WNK4Q96J92 1243 aa21.59■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 VEZTQ9HBM0 779 aa21.59■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 AOX1Q06278 1338 aa21.58■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.58■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 SPDYE6P0CI01 402 aa21.58■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.58■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.58■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 TRIM17Q9Y577 477 aa21.58■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.58■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.57■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 BEND3Q5T5X7 828 aa21.57■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.56■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.56■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.56■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 LAMB1P07942 1786 aa21.56■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 RASA3Q14644 834 aa21.55■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.55■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 GJA5P36382 358 aa21.54■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 OTOP1Q7RTM1 612 aa21.54■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 WDR63Q8IWG1 891 aa21.53■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 UNCXA6NJT0 531 aa21.52■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 GRM8O00222 908 aa21.52■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.52■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 OTOFQ9HC10 1997 aa21.52■■□□□ 1.04
TOP3B-217ENST00000489581 CRHR2Q13324 411 aa21.51■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.51■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.51■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.51■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 MRS2Q9HD23 443 aa21.51■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 CENPFP49454 3210 aa21.51■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.51■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 HTTP42858 3142 aa21.5■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 POTEFA5A3E0 1075 aa21.5■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 GYG1P46976 350 aa21.5■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 ERO1AQ96HE7 468 aa21.5■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 PTPN18Q99952 460 aa21.5■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 TNFAIP1Q13829 316 aa21.49■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 UBE4AQ14139 1066 aa21.49■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.49■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.49■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 ELP3Q9H9T3 547 aa21.49■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 OPTNQ96CV9 577 aa21.48■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.48■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.48■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.47■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.47■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 EFCC1Q9HA90 598 aa21.47■■□□□ 1.03
TOP3B-217ENST00000489581 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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