RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 SOX13Q9UN79 622 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 RECKO95980 971 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 NID1P14543 1247 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 EPHA1P21709 976 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 ITPKAP23677 461 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 CDC27P30260 824 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 GSTT1P30711 240 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 MSL1Q68DK7 614 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 C3orf58Q8NDZ4 430 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 DCAF5Q96JK2 942 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 BCL11AQ9H165 835 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF576Q9H609 170 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP4R2Q9NY27 417 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 AKAP2Q9Y2D5 859 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00114Q6XXX2 140 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM177BA6PVY3 158 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC01387J3KSC0 135 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 MSTNO14793 375 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXO24O75426 580 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 VAMP1P23763 118 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 FAAP100Q0VG06 881 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 LDLRAD1Q5T700 205 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM11Q96F44 468 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 CRELD1Q96HD1 420 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 BACH2Q9BYV9 841 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 PPME1Q9Y570 386 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 E9PSI1 815 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 H3BRJ5 948 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAM23O75077 832 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 ITGAEP38570 1179 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 CABP4P57796 275 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDH1Q08174 1060 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF423Q2M1K9 1284 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 HGSNATQ68CP4 663 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 TPTE2Q6XPS3 522 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM87AQ8NBN3 555 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 MKL2Q9ULH7 1088 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-211ENST00000489450 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 PROCP04070 461 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 IKBKEQ14164 716 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAPPC3LQ5T215 181 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 ILDR2Q71H61 639 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC7A3Q8WY07 619 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 CARD10Q9BWT7 1032 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 PLVAPQ9BX97 442 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 SEC31BQ9NQW1 1179 aa5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 USP31Q70CQ4 1352 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM229AH3BQW9 127 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 GNB5O14775 395 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 PODNQ7Z5L7 613 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 PPM1HQ9ULR3 514 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0A0MRY4 1105 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 FSCN2O14926 492 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 B3GALT4O96024 378 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 CELA3AP09093 270 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 PIP4K2BP78356 416 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 SETDB1Q15047 1291 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 XP32Q5T750 250 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM117BQ6P1L5 589 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 ENC1O14682 589 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 TM4SF5O14894 197 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 PAGE1O75459 146 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 GSTM4Q03013 218 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 C19orf57Q0VDD7 668 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 WNT8BQ93098 351 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 KLHDC7BQ96G42 594 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 CEP44Q9C0F1 390 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 F6X3S4 739 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 PIK3R2O00459 728 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-211ENST00000489450 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
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