RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488711.1

EHD1-210, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene EHD1, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-210ENST00000488711 RGMBQ6NW40 437 aa25.5■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.5■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.5■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.49■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 TSKSQ9UJT2 592 aa25.49■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 MOB2Q70IA6 237 aa25.48■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 MMP14P50281 582 aa25.47■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.47■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 CAPN15O75808 1086 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 NOGQ13253 232 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 DLGAP5Q15398 846 aa25.46■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
EHD1-210ENST00000488711 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.45■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 PDE8BO95263 885 aa25.45■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.45■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 KIF16BQ96L93 1317 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 CFAP100Q494V2 611 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 MEIS3Q99687 375 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 TNNQ9UQP3 1299 aa25.44■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 AOX1Q06278 1338 aa25.43■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 EYA2O00167 538 aa25.43■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 BCAR3O75815 825 aa25.43■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.43■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 CLRN2A0PK11 232 aa25.42■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.42■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 VPS37DQ86XT2 251 aa25.42■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.42■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 CCDC102AQ96A19 550 aa25.42■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 SLC10A3P09131 477 aa25.41■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 FKBP1BP68106 108 aa25.41■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.41■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 SIL1Q9H173 461 aa25.41■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.4■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 SPDYE6P0CI01 402 aa25.4■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 BCAMP50895 628 aa25.4■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 PRKG1Q13976 671 aa25.4■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 GRIK5Q16478 980 aa25.4■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.4■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.4■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.4■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 FGFR2P21802 821 aa25.39■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
EHD1-210ENST00000488711 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.39■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.39■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 TRIM27P14373 513 aa25.38■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 NF2P35240 595 aa25.38■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.38■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 VEZTQ9HBM0 779 aa25.38■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 FZD1Q9UP38 647 aa25.38■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 CA12O43570 354 aa25.36■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 MYO1BO43795 1136 aa25.36■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.36■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 SLC5A1P13866 664 aa25.35■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.35■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 LPIN2Q92539 896 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 CSRNP1Q96S65 589 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.34■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.33■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 CIAO1O76071 339 aa25.33■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 CRKP46108 304 aa25.33■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.33■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
EHD1-210ENST00000488711 GNAI3P08754 354 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD1-210ENST00000488711 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD1-210ENST00000488711 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD1-210ENST00000488711 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
EHD1-210ENST00000488711 FBXO3Q9UK99 471 aa25.32■■□□□ 1.64
EHD1-210ENST00000488711 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
EHD1-210ENST00000488711 ATP2B3Q16720 1220 aa25.31■■□□□ 1.64
EHD1-210ENST00000488711 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.31■■□□□ 1.64
EHD1-210ENST00000488711 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms